Question

****解决方案***

我不得不用双引号而不是单引号来包装查询。

如果我登录到以下mysql服务器：

mysql --user=genome --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A

然后运行以下查询：

select distinct 
    kgID, genesymbol, refseq 
from 
    kgXref 
where 
    genesymbol = 'GLRA1') a 
inner join 
    (select * from knownGene) b on a.kgID = b.name 
inner join 
    (select distinct 
         name, transcript, chromStart, chromEnd, 
         substr(peptides, 1, 1) as ref_pep,
         substr(peptides, 3, 1) as mut_pep 
     from 
         snp137CodingDbSnp) c on a.refseq = c.transcript

我得到了我想要的结果。

但是，如果我按以下方式运行：

mysql --user=genome --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A hg19 -D hg19 -e 'select distinct c.name,c.transcript from  (select distinct kgID,genesymbol,refseq from kgXref where genesymbol = 'GLRA1') a inner join (select * from knownGene) b on a.kgID = b.name inner join (SELECT distinct name, transcript,chromStart,chromEnd, substr(peptides,1,1) as ref_pep,substr(peptides,3,1) as mut_pep FROM snp137CodingDbSnp) c on a.refseq = c.transcript'

我收到以下错误

ERROR 1054（42S22）第1行：未知栏＆＃39; GLRA1＆＃39;在＆＃39; where子句＆＃39;

其中GLRA1不是列，而是列geneSymbol中的id。

为什么我登录服务器时查询有效，但是当我以第二种方式运行时却没有？

Answer 1

简单 - 你太早关闭“引用”：

-e 'select distinct c.name,c.transcript from  (select distinct kgID,genesymbol,refseq from kgXref where genesymbol = 'GLRA1')

'GLRA1之前将关闭select关键字之前的开场报价。

Mysql查询在服务器端执行时工作，但不在客户端执行

1 个答案: