query（包seqinr）：错误

Question

我正在使用此链接学习生物信息学： http://a-little-book-of-r-for-bioinformatics.readthedocs.org/en/latest/src/chapter3.html 我使用R 3.0.3和R studio，在运行下面的代码时出现错误，为什么？

library("seqinr")    
choosebank("refseqViruses")
query("Dengue1", "AC=NC_001477")
attributes(Dengue1)
Error: object 'Dengue1' not found

由于

Answer 1

所以我不确定它是否有帮助（我在看到这个问题之前没有使用过＆seqinr＆＃39;包），但是你试过调用＆＃39;属性（）＆＃39;带引号的功能？

> choosebank("refseqViruses")
> query("Dengue1", "AC=NC_001477")
> attributes(Dengue1)
Error: object 'Dengue1' not found

VS

> attributes("Dengue1")
NULL

那＆＃39; NULL＆＃39;是指一个空的对象，所以也许可以用另一个入藏ID来尝试？

希望有所帮助。

• 编辑：

将查询保存到变量并调用＆＃39; attributes（）＆＃39;在它上面，它支持一个空对象：

> d1<-query("Dengue1", "AC=NC_001477")
> attributes(d1)
$names
[1] "call"     "name"     "nelem"    "typelist" "req"      "socket" 
$class
[1] "qaw"