区域多边形未显示在ggplot2等值线图中

Question

我正在尝试用ggplot2做一个非常基本的地图。我找不到为什么彩色多边形不会显示。似乎我的代码与我在许多教程和本网站上已经回答的问题上找到的代码没有什么不同。我认为它可能来自我准备数据的方式（参见下面100％可重复的示例）。

library(maptools)
library(sp)
library(ggplot2)
library(rgeos)
con <- url("http://biogeo.ucdavis.edu/data/gadm2/R/GHA_adm1.RData")
print(load(con))
close(con)

ghaDF<-as.data.frame(gadm)
ghaDF$prod <- c(12, 26, 12,22,0,11,4,5,4,4) # add values for the regions to be colored with
gadm@data$id = rownames(gadm@data) #create an id in the shapefile data
ghaMap <- fortify(gadm, region="id")
colnames(ghaDF[5])<-"id"
ghaMap <- merge(ghaMap, ghaDF)

m0 <- ggplot(data=ghaMap)
m1 <- m0 + geom_polygon(aes(x=long, y=lat, fill = prod, group=group)) 
         + scale_fill_gradient(low = "light green", high = "dark green")
m2 <- m1 + geom_path(aes(x=long, y=lat, group=group),color='gray')  
         + coord_equal()
m2

在上图（m2的输出）中，区域应根据ghaMap$prod变量着色。有什么建议吗？

（R版本3.0.2 - 平台：x86_64-w64-mingw32 / x64（64位））

Answer 1

您的数据似乎很好。这是一个geom_map（和，colorbrewer颜色： - ）：

的解决方案

devtools::source_gist("https://gist.github.com/hrbrmstr/33baa3a79c5cfef0f6df")
gg <- ggplot()
gg <- gg + geom_map(data=ghaMap, map=ghaMap,
                    aes(map_id=id, group=group,
                        x=long, y=lat, fill=prod))
gg <- gg + scale_fill_gradient(low="#99d8c9", high="#00441b")
gg <- gg + coord_map()
gg <- gg + theme_map() + theme(legend.position="right")
gg

您可以省略devtools…和theme_map()而不影响解决方案。

编辑使用简化多边形

library(maptools)
library(sp)
library(ggplot2)
library(rgeos)
library(rgdal)

# get the shapefile
download.file("http://biogeo.ucdavis.edu/data/gadm2/shp/GHA_adm.zip", "GHA_adm.zip")
unzip("GHA_adm.zip", exdir="GHA_adm")

# simplify it
setwd("GHA_adm")
system("ogr2ogr -simplify 0.001 simple1.shp GHA_adm1.shp") # simplify (500K -> 80K)
setwd("..")

# read it in
gadm <- readOGR("GHA_adm", "simple1")

# convert it
gadm_map <- fortify(gadm, region="NAME_1")

# make the values we want to fill with
# you can use "ID_1" but folks I've seen generally like using names. works either way
prod <- data.frame(id=gadm$NAME_1, value=c(12, 26, 12, 22, 0, 11, 4, 5, 4, 4), stringsAs=FALSE)

# merge the data together
gadm_map <- merge(gadm_map, prod, all.x=TRUE) # add it right into the fortified data frame

# plot it
devtools::source_gist("https://gist.github.com/hrbrmstr/33baa3a79c5cfef0f6df")
gg <- ggplot()
gg <- gg + geom_map(data=gadm_map, map=gadm_map,
                    aes(map_id=id, group=group,
                        x=long, y=lat, fill=value))
gg <- gg + scale_fill_gradient(low="#99d8c9", high="#00441b")
gg <- gg + coord_map()
gg <- gg + theme_map() + theme(legend.position="right")
gg

（与上面相同的地图，边缘细节略少）

使用lsos（via）：

lsos()

##                               Type   Size Rows Columns
## gadm_map                data.frame 275256 5167       9
## gadm      SpatialPolygonsDataFrame 168296   10       9
## gg                              gg  34792    9      NA
## prod                    data.frame   2136   10       3

与OP相同：

##                               Type    Size  Rows Columns
## ghaMap                  data.frame 3689120 31735      18
## gadm      SpatialPolygonsDataFrame  589424    10      11
## gg                              gg   34792     9      NA
## ghaDF                   data.frame    5088    10      12
## con                            url     552     1      NA

Answer 2

你的问题非常简单。变化

colnames(ghaDF[5])<-"id"

到

colnames(ghaDF)[5]<-"id"

并且您的代码会生成您想要的地图。

上面的第一行提取ghaDF的第5列作为包含1列的数据框，将该列名设置为"id"，并在对colnames(...)的调用完成时将其丢弃。 它根本不会影响原始数据框。

第二行提取ghaDF的列名作为字符向量，并将该向量的第5个元素设置为"id"，这实际上更改了ghaDF的第5列的名称}。

说完这一切之后，你的工作流程有点折磨。首先，您要将gadm@data的所有列合并到ghaMap中，这是不必要且非常低效的。下面的代码生成相同的地图：

load(url("http://biogeo.ucdavis.edu/data/gadm2/R/GHA_adm1.RData"))
ghaMap <- fortify(gadm)
ghaDF  <- data.frame(id=rownames(gadm@data),
                     prod=c(12,26,12,22,0,11,4,5,4,4))
ghaMap <- merge(ghaMap,ghaDF)
ggplot(ghaMap, aes(x=long,y=lat,group=group))+
  geom_polygon(aes(fill=prod))+
  geom_path(color="gray")+
  scale_fill_gradient(low = "light green", high = "dark green")+
  coord_map()