Question

我有什么：在gx文件加载的networkx whit节点和egdes中导入的图表G.
问题：如何将新属性添加到选定边缘。
我想做什么：我想为图表的特定边E添加新属性'type'。注意：此边E不存在属性“type”。

我在互联网和这里阅读了很多解决方案，但这些解决方案中没有一个解决了我的问题。实际上我的代码是：

  G.edge[id_source][id_target]['type']= value

但是如果我打印G的所有边缘，现在我有n + 1条边，G的所有旧边和新边p =（id_source，id_target，{'type'= value}）。此外，旧边E（我想要修改的边）没有新属性'type'。

所以我的代码添加了一个新的边缘（我不想要） 我想要更新旧版本添加不存在的新属性。

感谢您的帮助！

编辑：已解决 感谢Aric和一些技巧，我解决了我的问题：

def add_attribute_to_edge(H,id_node_source,id_node_target,new_attr,value_attr):

      keydict =H[id_node_source][id_node_target]
      key=len(keydict)
      for k in keydict:
          if 'type' not in H.edge[id_source][id_target][k]:
             H.add_edge(id_node_source,id_node_target,key=k, new_attr= value_attr)

Answer 1

你可能有一个networkx MultiGraph而不是图形，在这种情况下，边缘的属性设置有点小问题。（您可以通过加载节点之间具有多个边缘的图形来获取多图形）。您可能通过分配属性来破坏数据结构您需要时G.edge[id_source][id_target]['type']= value G.edge[id_source][id_target][key]['type']= value。

以下是Graphs和MultiGraphs的不同工作方式示例。

对于Graph案例属性，可以这样工作：

In [1]: import networkx as nx

In [2]: G = nx.Graph()

In [3]: G.add_edge(1,2,color='red')

In [4]: G.edges(data=True)
Out[4]: [(1, 2, {'color': 'red'})]

In [5]: G.add_edge(1,2,color='blue')

In [6]: G.edges(data=True)
Out[6]: [(1, 2, {'color': 'blue'})]

In [7]: G[1][2]
Out[7]: {'color': 'blue'}

In [8]: G[1][2]['color']='green'

In [9]: G.edges(data=True)
Out[9]: [(1, 2, {'color': 'green'})]

使用MultiGraphs，还有一个额外级别的键可以跟踪平行边缘，因此它的工作方式略有不同。如果您没有明确设置密钥，MultiGraph.add_edge（）将添加一个带有内部选择键的新边（顺序整数）。

In [1]: import networkx as nx

In [2]: G = nx.MultiGraph()

In [3]: G.add_edge(1,2,color='red')

In [4]: G.edges(data=True)
Out[4]: [(1, 2, {'color': 'red'})]

In [5]: G.add_edge(1,2,color='blue')

In [6]: G.edges(data=True)
Out[6]: [(1, 2, {'color': 'red'}), (1, 2, {'color': 'blue'})]

In [7]: G.edges(data=True,keys=True)
Out[7]: [(1, 2, 0, {'color': 'red'}), (1, 2, 1, {'color': 'blue'})]

In [8]: G.add_edge(1,2,key=0,color='blue')

In [9]: G.edges(data=True,keys=True)
Out[9]: [(1, 2, 0, {'color': 'blue'}), (1, 2, 1, {'color': 'blue'})]

In [10]: G[1][2]
Out[10]: {0: {'color': 'blue'}, 1: {'color': 'blue'}}

In [11]: G[1][2][0]['color']='green'

In [12]: G.edges(data=True,keys=True)
Out[12]: [(1, 2, 0, {'color': 'green'}), (1, 2, 1, {'color': 'blue'})]

Answer 2

我不太清楚你为什么只想在一条边上添加一个属性，而是可以在所有边上添加一个属性，然后将the wanted value赋予你的特定边缘。

Networkx有一个名为set_edge_attributes的方法可以为所有边添加边属性，例如

    G = nx.path_graph(3)
    bb = nx.edge_betweenness_centrality(G, normalized=False)
    nx.set_edge_attributes(G, 'betweenness', bb)
    G[1][2]['betweenness']

输出：2.0

Answer 3

实际上，有一种更好的简短方法可以将新属性添加到图表中的现有边缘：

>>> for itr in G.edges_iter(None, True, True):
        itr

(0, 1, {})
(0, 2, {'edge': (0, 2)})
(0, 3, {})
(0, 4, {})
(1, 2, {})
(1, 3, {})
(2, 3, {})
(2, 4, {})
(3, 4, {})
>>> G[0][1].update(edge=(0,1))      #This will add 'edge'=(0,1) dict item to edge(0,1)
>>> for itr in G.edges_iter(None, True, True):
        itr


(0, 1, {'edge': (0, 1)})
(0, 2, {'edge': (0, 2)})
(0, 3, {})
(0, 4, {})
(1, 2, {})
(1, 3, {})
(2, 3, {})
(2, 4, {})
(3, 4, {})

Answer 4

下面李新峰的答案起作用了，只是注意values和name的参数在Networkx v1.x（最初编写答案时）和Networkx v2.x之间切换。对于v2.x，代码为：

G = nx.path_graph(3)
bb = nx.edge_betweenness_centrality(G, normalized=False)
nx.set_edge_attributes(G, bb, 'betweenness')
G[1][2]['betweenness']

Answer 5

从OP的问题中添加的解决方案：

感谢Aric和一些技巧，我解决了我的问题：

def add_attribute_to_edge(H,id_node_source,id_node_target,new_attr,value_attr):

      keydict =H[id_node_source][id_node_target]
      key=len(keydict)
      for k in keydict:
          if 'type' not in H.edge[id_source][id_target][k]:
             H.add_edge(id_node_source,id_node_target,key=k, new_attr= value_attr)

将新属性添加到networkx中的边缘

5 个答案: