Ion Torrent PGM原始数据

时间:2014-10-30 10:16:19

标签: server ion torrent sequencing

我只是想知道在哪里可以找到Ion Torrent服务器上的原始序列数据。我在看这个目录 /结果/分析/输出/主页/ [mystudy]

我发现以下文件接近我需要但不完全

  • 此文件中的读取已经删除了条形码 /results/analysis/output/Home/[mystudy]/rawlib.bam

  • 这个似乎只包含Ion torrent软件无法找到匹配条形码的读数 /results/analysis/output/Home/[mystudy]/basecaller_results/unfiltered.untrimmed/rawlib.bam

基本上,我想在核苷酸被调用并存储在大概fastq文件之后,但在进行任何进一步分析(如条形码识别和修剪)之前,自己处理原始序列数据。

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