fread(data.table)选择列,如果找不到列则抛出错误

时间:2014-10-29 22:44:56

标签: r data.table

我正在使用data.table的fread函数将csvfile加载到R中。它有一堆我不需要的列,因此select参数派上用场。但是,我注意到,如果在csvfile中不存在select中指定的列之一,则fread将以静默方式继续。如果csvfile中不存在其中一个选定列,是否可以使R抛出错误?

#csvfile has "col1" "col2" "col3" "col4" etc

colsToKeep <- c("col1", "col2" "missing")

data <- fread(csvfile, header=TRUE, select=colsToKeep, verbose=TRUE)

在上面的示例中,data将包含两列:col1col2。其余列将按预期删除,但会以missing静默跳过。很高兴知道fread正在跳过该列,因为它没有找到它。

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

我建议先抢先解析第一行,然后抛出自己的错误。你可以这样做:

read_cols <- function(file_name, colsToKeep) {
    header <- fread(file_name, nrows = 1, header = FALSE)
    all_in_header <- all(colsToKeep %chin% unlist(header))
    stopifnot(all_in_header)

    fread(file_name, header=TRUE, select=colsToKeep, verbose=TRUE)
}

my_data <- read_cols(csvfile, c("col1", "col2" "missing"))