Question

我在R中遇到一个我似乎无法弄清楚的错误。我正在创建一个R markdown文档，我在这里使用此代码读取了一个csv表。

iati <- read.csv(file="/filepath/IATI_NGOS.csv",head=TRUE,sep=",")

然后使用ggplot2我使用以下代码创建一个图。

figure_one <- ggplot(iati, aes(iati$reporting.org))+
              geom_bar(fill="blue")+
              ylab("Total Activities")+
              xlab("NGO Reporting Organizations in IATI")+
              ggtitle("Total Number of Activities compared to each NGO Reporting Organization in IATI")+
              coord_flip()

当我尝试在R markdown中调用figure_one时，我收到以下错误：

Quitting from lines 44-55 (NGO_IATI.Rmd) 
Error in gsub("(?<=\n)(?=.|\n)", continue, x, perl = TRUE) : 
input string 1 is invalid UTF-8
Calls: <Anonymous> ... paste -> comment_out -> line_prompt -> paste -> gsub
In addition: Warning message:
In grep("\n", message) : input string 1 is invalid in this locale
Execution halted

当我在常规R脚本中运行此代码时，我绝对没有问题。我已经找到了一些答案，但无法弄明白。

谢谢！

Answer 1

我刚刚在本地机器上全新安装了R和Rstudio来解决我的问题。我认为最近在我的本地环境中对Yosemite的更新给我为R markdown安装的TeX插件带来了很多问题。

Answer 2

当我编织我的rmarkdown文档并发现** encoding是原因时，我遇到了同样的问题。使用4.9.4，read.csv或fread之类的函数时，您将读取列名。

如果列名使用其他语言（例如中文），则问题很容易发生。
或者您在Windows上运行rmarkdown，但在另一种环境Mac上发生编码错误。

临时解决方案是用英语重命名列名并重新保存数据文件。

这是R中的伪代码，以表明我的想法。

read_csv

在这里，新文件library(data.table) library(tidyverse) fread('yourfile.csv',encoding = 'UTF-8') %>% purrr::set_names(c('x1','x2','x3')) %>% write_excel_csv('yourfile_2.csv')非常适合rmarkdown编织，而不会发生编码问题。

R.中的错误gsub中的错误（“（？＆lt; = \ n）（？=。| \ n）”，继续，x，perl = TRUE）：

2 个答案: