Question

我必须要合并多个文件。

这是两个文件。

的1.txt

Allele Sequence
B*07:02:01 ABCDE
B*07:33:01 ABCD
B*07:41 AB

2.txt

Allele Sequence
B*07:02:01 FGHIJ     
B*07:33:01 EFGH
B*07:41 CD

分隔符是Tab（\ t）

我希望得到像

这样的结果

B*07:02:01 ABCDEFGHIJ     
B*07:33:01 ABCDEFGH
B*07:41 ABCD

我试过以下。

awk -F"\t" '
    {key = $1}
    FNR==NR {line[key]=$0; next}
    key in line {print line[$1], $2}
' $1 $2 > output_2.txt

然后结果如

Allele  Sequence^M Sequence^M
B*07:02:01 ABCDE^M FGHIJ     
B*07:33:01 ABCD^M EFGH
B*07:41 AB^M CD

如何更清晰，更准确地说出我想要的内容

谢谢！

Answer 1

这可能有效：

awk 'FNR==NR {a[$1]=$2;next} FNR>1{print $0 a[$1]} ' 2.txt 1.txt
B*07:02:01 ABCDEFGHIJ
B*07:33:01 ABCDEFGH
B*07:41 ABCD

工作原理：

awk '
FNR==NR {           # For first file only (2.txt)
    a[$1]=$2        # Read data in to array a using $1 as key and $2 as value
    next}           # Skip to next record
FNR>1{              # Skip first record of second file (1.txt)
    print $0 a[$1]} # Print complete record from 1.txt, and data from array using $1 as key
' 2.txt 1.txt       # read the files

Answer 2

awk -F"\t" '
         {gsub("\r",""); key = $1}
         FNR==NR {line[key]=$0; next}
         key in line {print line[$1]$2}
     ' 1d.txt 2d.txt > x

gsub将删除您遇到问题的“^ M”（它是chr（13）= CR，因为您的输入文件来自使用CRLF的DOS / Windows世界，然后您正在处理UN * X，仅使用LF作为行分隔符）
删除line[$1]$2中的“，”将删除空格

Answer 3

join 1.txt 2.txt | awk '{print $1, $2 $3}'

Linux结合了多个文件

3 个答案: