在没有换行的情况下将字符串添加到文本文件的开头

Question

因此，我尝试将一些大型制表符分隔txt文件（200 MB）导入R进行统计分析。不幸的是，文件格式与列/行数不一致。第一行包含除前两列之外的所有列的标题名称。

示例：

header3 header4 header5

column1 column2 column3 column4 column5

我可以在将文件读入R后修复该文件，但更优雅的方法是将header1 header2插入文件中。 我试过了：

cat file_with_missing_headers main_file > new_file

这导致两者之间的新界限。有没有办法压制新线？
或者也许是另一种工具？

Answer 1

解决方案1 ​​

$ { echo -n "header1 header2 "; cat file; } >newfile

-n会抑制不需要的换行符。

解决方案2

使用sed：

$ sed '1s/^/header1 header2 /' file >newfile

由于1，这会对file的第一行（仅第一行）进行替换。插入符^匹配第一行的开头。标题在行的开头被替换，文件的其余部分保持不变。

Answer 2

在R中，您可以忽略第一行，然后创建一组新名称。例如，使用

setNames(read.table(fileName, skip = 1), paste0("header", 1:5))

将读取文件并一次性设置新列名。请注意，read.table的默认分隔符为sep = ""，因此如果是csv文件，则需要将其更改为sep = ","。

然后，当您完成后，您可以使用write.table将新数据集写入同一文件，下次使用数据时无需担心这一点。