从HDF5文件中删除数据集属性

Question

我想要通过删除其中一个数据集的属性来修改hdf5文件并保存文件而不进行进一步更改。我可以在hdfview中执行此操作，但我需要一些可编写脚本的东西，因为它需要应用于大量文件。

我尝试使用h5py：

在python中编写脚本

import h5py
inF = h5py.File("Filename.h5", 'r')
dSet = inF['/data/myDataset']
del dSet.attrs['myAttrName']

但是我收到以下错误：

  

Traceback（最近一次调用最后一次）：文件“”，第1行，in      文件“/usr/lib/python2.7/dist-packages/h5py/_hl/attrs.py”，   第75行， delitem       h5a.delete（self._id，self._e（name））文件“h5a.pyx”，第135行，位于h5py.h5a.delete（h5py / h5a.c：2682）KeyError：“无法删除   属性（属性：无法删除消息）“

print dSet.attrs['myAttrName']生成正确的值，证明我可以访问该属性。

还有其他方法吗？也许使用h5repack？

Answer 1

h5py脚本的问题是您以只读模式（“r”）打开了文件。你需要打开with append，如下：

inF = h5py.File("Filename.h5", 'a')

Answer 2

我最终使用了一个hdf工具 - h5copy：

h5copy -p -i inputFile.h5 -o outputFile.h5 -s /inputDataSetName -d /outputDataSetName -f noattr

由于我必须处理的所有文件都具有相同的数据集，而且数据集的数量相当少，所以我编写了一个shell脚本，每个脚本都调用h5copy。

请注意，在a组上运行h5copy不会删除该组中所有数据集的属性。