使用双管分隔符读取大文本文件

Question

使用R，我试图用||读取一个大的（1.3 g）文本文件双管分隔符。具体来说，它看起来像这样：

||Header1||,||header2||,||Header3||
||0.001||,||0.002||,||0.003||

我在here描述的fread功能方面取得了成功。但是，该函数不允许具有多于1个字符的分隔符。因此，当我设置sep =＆＃34; auto＆＃34;时，我会得到具有正确值的单元格，但它们具有＆＃34; ||＆＃34;在双方。

我会在文本编辑器中进行查找和替换以更改＆＃34; ||＆＃34; to＆＃34;，＆＃34;，但它太大而无法在合理的时间内完成。

你的帮助是一个救命的人。谢谢！

Answer 1

那些看起来不是分隔符，但也许它们是，我只是不知道它。无论哪种方式，不是将||更改为,，而是可以简单地删除它们，然后可以将生成的矢量放入read.csv的数据框中。

在下面g的代码中，将textConnection(txt)替换为您的文件名。

txt <- "||Header1||,||header2||,||Header3||
||0.001||,||0.002||,||0.003||"
g <- gsub("||", "", readLines(textConnection(txt)), fixed=TRUE)
read.csv(text = g)
#   Header1 header2 Header3
# 1   0.001   0.002   0.003