我在以下文件夹结构中压缩了文本文件:
~/A/1/1.faa.tgz #each tgz file has dozens of faa text files
~/A/2/2.faa.tgz
~/A/3/3.faa.tgz
我想从每个tgz文件中提取faa文件(文本),然后使用subfoldername(1,2和3)连接它们,为每个子文件夹创建一个文本文件。
我的尝试如下,但文件是在我运行脚本的文件夹中提取的:
#!/bin/bash
for FILE in ~/A/*/*.faa.tgz; do
tar -vzxf "$FILE"
done
提取faa文件后,我会使用" cat"加入他们(例如,使用cat * .faa> .txt。
提前致谢。
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提取: #!/斌/庆典
for FILE in ~/A/*/*.faa.tgz; do
echo "$FILE"
mkdir "`basename "$FILE"`"
tar -vzxf "$FILE" -C "`basename "$FILE"`"
done
加入:
#!/bin/bash
for dir in ~/A/*/; do
(
cd "$dir"
file=( *.faa )
cat "${file[@]}" > "${PWD##*/}.txt"
)
done