搜索子文件夹中的多个文件并仅打印数值

Question

我对使用TWO模式在子文件夹中搜索多个文件的内联操作有疑问，并且只打印数值。

示例：

当前目录：$HOME/work/A/（运行脚本的位置）

包含数据的子文件夹：$HOME/work/A/trial1, trial2, trial3..

输入（每个数据文件）：例如。 trial1/trial1.out

[text]
..
cutoff = 100
..
[text] 
..
! total energy= -23.4387 Ry
.. 

需要输出：/A/totalenergy.txt

100   -23.4387
110   -23.2523
120   -24.0134
...

我最初的计划是使用＆＃39; grep＆＃39;搜索每个文件并匹配模式＆＃39; cutoff =＆＃39;和＆＃39;！ ＆＃39;找到两条所需的线，并只打印截止数和能量数。

然而，到目前为止，我能做的只是搜索1种模式，＆＃39;！总能量＆＃39; （更重要的是），并使用grep | tr | cut > file来获取能量。

grep -e "\!" */*.out | tr -s ' ' | cut -f5 -d' ' >totalenergy.txt

基本上，我在寻找＆＃39;！＆＃39;，搜索所有子文件夹以获取* .out，修剪多个空格，并仅保留数字字段

包含＆＃39;！的行总能量＆＃39;使用grep之后看起来像这样

60/C.scf_60.out:!    total energy              =     -22.78085574 Ry

所以，如果我能以某种方式从这一行获得第一个号码，加上我拥有的号码，我也可以实现我的目标：

60  -22.78085574

我试图用一行命令来做这件事。

谢谢！

Answer 1

sed -rn -e 's/cutoff[ =]+([0-9]+)/\1/p' -e 's/.*total energy[= ]+([0-9.-]+).*/\1:/p' */*.out | tr '\n:' ' \n'

---

说明：

sed -rn -e <cmd1> -e <cmd2> */*.out

我已使用sed代替grep因为我不得不使用标记（我选择:）来分隔每个寄存器（ cutoff < / em> total_energy ）。

sed选项

-r # short form of --regexp-extended

需要与我使用的sintax相匹配。特别([0-9.-]+) - ＆gt;我没有必要逃避括号，我可以毫无问题地过滤.-。

-n # short option of --quiet or --silent

除非我们明确要求这样做（使用标记p）

，否则会禁用模式打印

-e # short of --expression

用于组合多个命令

模式和替换

cutoff[ =]+([0-9]+)/\1
.*total energy[= ]+([0-9.-]+).*/\1:

我只是保存 \1中我需要的值。

请注意，我在总能量匹配的值之后添加了:个字符。正如我所说，它是帮助我将寄存器与tr分开。

sed flag

's/../../p'

我已使用p打印模式，因为我已使用-n禁用了打印功能。它需要丢弃没有匹配的所有行。

---

tr '\n:' ' \n'

由于sed输出了不同行中的每个值，我使用了一个标记（:）来知道在哪里写一个换行符（\n）。

字符替换

tr正在将SET1（'\n:'）中的字符转换为SET2（' \n'）中的字符。翻译将取代SET1中的每个字符，SET2中的每个字符位于相同的位置：

# \n  ->  " " (space)
# :   ->  \n

注意：您可能希望再次管道（| tr -s ' '）来清理输出

---

格式化输出

的另一种方法

更严格的打印结果方法是再次sed，因此输出完全符合您的要求：

sed -rn -e 's/cutoff[ =]+([0-9]+)/\1/p' -e 's/.*total energy[= ]+([0-9.-]+).*/\1:/p' */*.out | tr '\n' ' ' | sed -r "s/([^:]+):[ ]*/\1\n/g"

请注意，util第一个|命令与上面的命令完全相同。

tr '\n' ' '

它只是用空格替换换行符。

sed -r "s/([^:]+):[ ]*/\1\n/g"

将保存字符串直到:并打印后跟换行符