自动化RStudio处理RMarkdown？

Question

我有一个RMarkdown文件，用于生成一个不错的HTML报告。 问题是，我希望能够自动化它，以便它可以在无头服务器上运行。因此，没有人可以启动Rstudio并按下'knithtml'按钮，看起来Rstudio正在做很多额外的魔术，比如拥有它自己的pandoc版本，运行所有必要的命令，应用css样式等。

当我按下“knithtml”按钮时，如何通过运行R脚本来获取Rstudio生成的报告并生成相同的内容？

感谢。

Answer 1

尝试使用

rmarkdown::render("/PATH/TO/YOUR.Rmd", output_file="/PATH/TO/YOUR/OUTPUT.html")

代替。这假设您已经在无头框上加载了rmarkdown库。它将使用系统pandoc，但要确保它是1.12或更高。

这是knit2html所做的事情（通过＆＃34; R Markdown＆＃34;标签靠近＆＃34;控制台＆＃34;）：

这是一个并排的。左边是单击按钮，右边是运行命令：

Answer 2

我有同样的问题。经过大量的暴力破解后，使用以下命令行可以获得与RStudio相同的结果：

"path\to\Rscript.exe" -e "rmarkdown::find_pandoc(dir='path/to/RStudio/bin/pandoc'); rmarkdown::render('file.Rmd')"