Question

我有2个CSV文件，我想将其转换为Neo4j数据库。它们看起来像这样：

first file:

name,enzyme
Aminomonas paucivorans,M1.Apa12260I
Aminomonas paucivorans,M2.Apa12260I
Bacillus cellulosilyticus,M1.BceNI
Bacillus cellulosilyticus,M2.BceNI

second file 

name,motif
Aminomonas paucivorans,GGAGNNNNNGGC
Aminomonas paucivorans,GGAGNNNNNGGC
Bacillus cellulosilyticus,CCCNNNNNCTC

正如您所看到的，共同因素是有机体的名称和。每个生物都会有几个酶，每个酶都有1个主题。酶之间的基序可以相同。我使用以下语句来创建我的数据库：

USING PERIODIC COMMIT
LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:C:/Users/Desktop.n_e.csv" AS csvLine
MATCH (o:Organism { name: csvLine.name}),(e:Enzyme { name: csvLine.enzyme})
CREATE (o)-[:has_enzyme]->(e)

USING PERIODIC COMMIT
LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:C:/Users/Desktop/n_m.csv" AS csvLine
MATCH (o:Organism { name: csvLine.name}),(m:Motif { name: csvLine.motif})
CREATE (o)-[:has_motif]->(m)

但是我一直收到错误Cannot merge node using null property value for name (Failure when processing URL 'file:C:/Users/Desktop/n_e.csv' on line 2. No rows seem to have been committed. Note that this information might not be accurate.)。我搜索了这个问题，但没有找到解决方法。我确保我的CSV是“vanilla”csv（没有空格，只有逗号分隔）。但我一直遇到这个问题。我正在使用Neo4j的2.1.3版本。任何帮助都将受到高度赞赏。

文件1：n_e.csv 文件2：n_m.csv

Answer 1

更新至2.1.5
阅读此博客文章，了解如何正确检查your data is read。
此外，您可能会检查您是否没有Windows换行符或UTF 2字节文件前导码
检查您是否有以下索引：有机体（名称）和：酶（名称）和：Motif（名称）到位

一般情况下，请尝试并检查输出：

LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:C:/Users/Desktop.n_e.csv" AS csvLine
RETURN csvLine
LIMIT 5

LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:C:/Users/Desktop.n_e.csv" AS csvLine
RETURN csvLine.name,csvLine.enzyme 
LIMIT 5

Answer 2

在我的情况下，原因是标题行中的空格。例如，CVS文件：

Name, Surname, City
Jan, Kowalski, Gdansk

所以，Name导入正常，但Surname未被识别（为空），就像逗号和Surname之间的空格一样。删除后，它开始工作。

无法合并节点错误：Neo4j

2 个答案: