有没有人试图在'鼠标'包中并行化多重插补？

Question

我意识到Amelia R包为并行 多重插补（MI）提供了一些支持。但是，对我研究数据的初步分析显示，数据不 多元正常，所以，遗憾的是，我无法使用{{1} }。因此，我已切换到使用Amelia mice包用于MI，因为此程序包可以对非多变量正常的数据执行MI。

由于R的MI流程非常慢（目前我正在使用AWS mice 2核实例），我开始怀疑是否可以并行化程序以节省处理时间。根据我对m3.large文档和相应JSS文章以及mice源代码的评论，看来目前该软件包不支持并行操作。这很难过，因为恕我直言，MICE算法自然并行，因此，它的并行实现应该相对容易，并且会在时间和资源方面带来显着的经济效益。

问题有没有人尝试在mice包中并行化MI，无论是在外部（通过mice并行设施），还是在内部（通过修改源代码）和什么是结果，如果有的话？谢谢！

Answer 1

最近，我尝试在外部通过mice软件包并行化多重插补（MI），即使用R多处理工具，特别是{ {1}}包，标配parallel基本分发。基本上，解决方案是使用R函数来分配所需MI迭代总数的预先计算的份额，然后将得到的估算数据组合到单个对象中。 性能方面，这种方法的结果超出了我最乐观的预期：处理时间从1.5小时减少到 7分钟以下（！ ）。那只是在两个核心上。我删除了一个多级因素，但它不会产生太大影响。无论如何，结果令人难以置信！