在TORQUE qsub请求中排除特定节点

Question

我校园中的群集使用PBS TORQUE进行作业管理。

软件中有几个节点已过时。如果我的作业被发送到其中一个节点，它将失败。有没有办法在作业请求中排除特定节点（或节点列表）？

Answer 1

我不确定您是否可以指定作业可以选择的套装。您可以指定节点列表，但在作业运行之前，您必须等待所有节点都空闲。根据您需要排除的节点数量，您可以执行类似的操作。

cat $PBS_NODEFILE | grep -v badnode1 |grep -v badnode2 > goodnodes NP=wc -l goodnodes #need back ticks around "wc -l goodnodes" mpirun -np $NP -machinefile goodnodes ./a.out

如果您以任何方式收取资源费用，这不是理想的选择，但它可以帮助您完成工作。