Question

我在python中编写脚本，它解析了大约500张图像（3d对象的切片），宽度为1810px，高度为1808px。我想从所有这些图像中写入点（带原始颜色）并将它们保存为vtk文件格式。出于测试目的，我从vtk修改了示例：

import vtk
from vtk import *

#setup points and vertices
Points = vtk.vtkPoints()
Vertices = vtk.vtkCellArray()

for x in xrange(0, 1808):
    for y in xrange(0, 1810):
        for z in xrange(0, 544):
            id = Points.InsertNextPoint(x, y, z)
            Vertices.InsertNextCell(1)
            Vertices.InsertCellPoint(id)


polydata = vtk.vtkPolyData()
polydata.SetPoints(Points)
polydata.SetVerts(Vertices)
polydata.Modified()
if vtk.VTK_MAJOR_VERSION <= 5:
    polydata.Update()

writer = vtk.vtkXMLPolyDataWriter()
writer.SetFileName("TriangleColoredPoints.vtp")
if vtk.VTK_MAJOR_VERSION <= 5:
    writer.SetInput(polydata)
else:
    writer.SetInputData(polydata)
writer.Write()

目前它甚至没有读取图像，但问题是，当我添加所有这些点时，我就会内存不足。有没有办法以块的形式保存这些点？

Answer 1

看起来你正在尝试写一个1800x1800x500点（大约16亿点）的聚合数据。数百万可能是可能的，但不是数十亿，无论如何还没有。看起来您需要减少问题的大小。如果确实减小了问题大小，请使用vtkXMLPolyDataWriter。它有

writer->SetDataModeToBinary();
writer->SetCompressorTypeToZLib();

在将大型模型紧凑地编写到文件系统中非常有用。

或者，您可以将图像存储为单个体积（1800x1800x500，vtkImageData），如上面的注释所述，但仍然会有非常大的内存使用。然后你可以进行体积渲染或行进立方体以获得表面等。但是没有更多的细节是你想要实现的，它很难再回答。

将大量积分写入vtk文件格式

1 个答案: