在HDFStore中存储后获取nan值

Question

我使用以下代码NaN / HDFStore在python中存储包含大量pandas值的大数据集：

with get_store(work_path+'/stores/store.h5') as store:
        for chunk in reader:
            for column in column_list:
                store.append('%s' % column, chunk[column],
                             data_columns=column)

然后我想将第一列加载为numpy数组，所以我有：

array = store.select(column_list[0]).as_matrix()

问题是我得到一个没有任何初始NaN值的小数组，因为当我将数据存储在商店中时，它有点＆＃34;忘记＆＃34; NaN值，仅保留非NaN值及其索引。如何使用初始NaN值返回数组？

Answer 1

您需要传递dropna=False，请参阅here

仅供参考，您基本上是在创建一个列存储（可能更好地解决您的问题）。