C，openMPI：从每个进程向所有其他进程分发数据块的最佳方法是什么？

Question

在我的mpi程序中，每个进程都有一个或一组数据：

char *datablock;

块类似但不相同大小。

将这些块从每个进程分发到另一个进程的最佳方式（使用的功能和方式）是什么？ 最后，我希望每个进程都有（可能）所有块的数组：

char **blockarray;

这样

*blockarray[i] // for i in [0... number_of_processes-1]

是第i个过程的前一个块。 但重要的不是订单，＆＃34;我＆＃34;不必是进程ID，订单可以在每个进程上有所不同（如果这更快）！ 我只想以最快的方式获得每个线程上的每个块。

Answer 1

您应该使用MPI_Allgatherv请查看此处的文档： http://mpi.deino.net/mpi_functions/MPI_Allgatherv.html

使用此功能，您可以将每个流程的数据分发到所有其他流程。

您不需要char *datablock;您只需拥有char **blockarray;每次需要同步您拨打MPI_Allgatherv的数据时。伪代码：

id = process_id
recvcounts = [length(blockarray[0]), length(blockarray[1]), ...]
disply = [0, recvcounts[1], recvcounts[0]+recvounts[1], ...]

MPI_Allgatherv(*blockarray[id], length(*blockarray[id]), sendtype, *blockarray, *recvcounts, 
               *displs, recvtype, comm);