Question

亲爱的，我需要一些帮助。

我有这个输入文件：

 chr1
 chr1 
 chr2 
 chr2 
 chr3 
 chr3

我想将它分成以下输出文件：

＆＃34;第一个文件＆＃34;

chr1
chr1
chr1

＆＃34;第二个文件＆＃34;

chr2 
chr2

＆＃34;第三个文件＆＃34;

chr3
chr3

我正在使用此代码，但它无效

for i in {1..3}                 
do 
    awk '{if ($1 == "chr"$i) {print $0}}' 17_n.tsv > $i 
done

Answer 1

也许你可以使用这样的东西：

$ cat file
 chr1
 chr1
 chr2
 chr2
 chr3
 chr3
$ awk '{suffix = substr($1, length($1)); print > "file" suffix}' file
$ cat file1
 chr1
 chr1
$ cat file2
 chr2
 chr2
$ cat file3
 chr3
 chr3

基本上，取第一个字段的最后一个字符并用它来确定文件名。

如果最后可以有多个数字，您可以改用：

awk 'match($1, /[0-9]+$/) { print > ("file" substr($1, RSTART)) }' file

match将RSTART设置为匹配开头的位置，因此可以与substr一起使用以提取输入的数字部分。

Answer 2

如果您的行格式为N non-number chars + N numbers，则可以尝试：

awk '{f=$0;sub(/^[^0-9]*/,"",f);print >("output"f)}' input

这对ch0r1无效。

如果您希望它也适用于ch0r1，请使用 gawk ：

awk '{f=gensub(/^.*[^0-9]([0-9]*)$/,"\\1","g");print >("output"f)}' file

Answer 3

由于awk是一种与其自己的解释器不同的语言，bash变量无法在awk中正确使用而不首先使用-v选项传递它们。另外，awk中的默认操作是打印，因此您不需要{print $0}。

所以这会奏效：

for i in {1..3}                 
do 
    awk -v i=$i '$1 == "chr"i' 17_n.tsv > $i 
done

也就是说，你也可以在read循环中完成你想要的东西：

while read -r line
do
    [[ $line == chr+([0-9]) ]] && echo $line >> ${line#chr}
done < 17_n.tsv

awk - 循环中由条件分隔1列

3 个答案: