根据第二个列表过滤一个列表

时间:2014-09-16 11:31:54

标签: grep filtering

我的基因型文件包含> 950,000行,如下所示:

24  rs2641123   0   59027434
24  rs4893711   0   59027575
24  rs4047329   0   59027910
24  rs28698289  0   59028502
24  rs2334088   0   59029364
24  rs6568298   0   59029728
24  rs4047343   0   59030922

其中第二列包含每行的唯一代码。

我想根据列表过滤基因型文件,该列表仅包含要排除的唯一代码的名称。该列表如下所示:

rs2641123
rs4893711
rs28698289
rs2334088

原则上,两个文件中的代码都以相同的方式排序。

我想过使用grep,但我不确定如何实现它。

谢谢!

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