对于小型矩阵,纯Haskell比HMatrix快10倍-100倍?

时间:2014-09-14 15:45:00

标签: performance haskell matrix

我们将大部分CPU周期用于涉及小矩阵的操作,因此我想知道是否可以针对该情况进行优化。请考虑以下代码:

module Main where

import Numeric.LinearAlgebra.HMatrix
import Criterion.Main


data Matrix2x2 = Matrix2x2 {-# UNPACK #-} !Double !Double !Double !Double

mul2x2p :: Matrix2x2 -> Matrix2x2 -> Matrix2x2
mul2x2p (Matrix2x2 a1 b1 c1 d1) (Matrix2x2 a2 b2 c2 d2) =
  Matrix2x2 (a1*a2 + b1*c2) (a1*b2 + b1*d2) (c1*a2 + d1*c2) (c1*b2 + d1*d2)

inv2x2 :: Matrix2x2 -> Matrix2x2
inv2x2 (Matrix2x2 a b c d) =
  let detInv = a * d - b * c
  in Matrix2x2 (d / detInv) (-b / detInv) (-c / detInv) (a / detInv)

add2x2 (Matrix2x2 a1 b1 c1 d1) (Matrix2x2 a2 b2 c2 d2) =
  Matrix2x2 (a1+a2) (b1+b2) (c1+c2) (d1+d2)

hm1 = matrix 2 [1, 2, 3, 4]
hm2 = matrix 2 [5, 6, 7, 8]

pm1 = Matrix2x2 1 2 3 4
pm2 = Matrix2x2 5 6 7 8

main = defaultMain [
  bgroup "matrix tests" [ bench "pure mult"     $ whnf (mul2x2p pm1) pm2
                        , bench "hmatrix mult"  $ whnf (hm1 <>) hm2
                        , bench "pure add"      $ whnf (add2x2 pm1) pm2
                        , bench "hmatrix add"   $ whnf (hm1 +) hm2
                        , bench "pure inv"      $ whnf inv2x2 pm1
                        , bench "hmatrix inv"   $ whnf inv hm1
                        ]]

结果:

benchmarking matrix tests/pure mult
time                 6.461 ns   (6.368 ns .. 6.553 ns)
                     0.999 R²   (0.998 R² .. 0.999 R²)
mean                 6.482 ns   (6.394 ns .. 6.594 ns)
std dev              345.1 ps   (271.4 ps .. 477.3 ps)
variance introduced by outliers: 77% (severely inflated)

benchmarking matrix tests/hmatrix mult
time                 180.6 ns   (178.2 ns .. 183.1 ns)
                     0.999 R²   (0.998 R² .. 0.999 R²)
mean                 183.0 ns   (180.6 ns .. 186.3 ns)
std dev              9.363 ns   (7.405 ns .. 12.73 ns)
variance introduced by outliers: 71% (severely inflated)

benchmarking matrix tests/pure add
time                 6.262 ns   (6.223 ns .. 6.297 ns)
                     0.999 R²   (0.999 R² .. 1.000 R²)
mean                 6.281 ns   (6.220 ns .. 6.355 ns)
std dev              235.0 ps   (183.3 ps .. 321.0 ps)
variance introduced by outliers: 62% (severely inflated)

benchmarking matrix tests/hmatrix add
time                 116.4 ns   (115.0 ns .. 117.9 ns)
                     0.999 R²   (0.998 R² .. 0.999 R²)
mean                 116.3 ns   (115.2 ns .. 117.7 ns)
std dev              4.176 ns   (3.447 ns .. 5.150 ns)
variance introduced by outliers: 55% (severely inflated)

benchmarking matrix tests/pure inv
time                 7.811 ns   (7.718 ns .. 7.931 ns)
                     0.999 R²   (0.998 R² .. 0.999 R²)
mean                 7.895 ns   (7.808 ns .. 7.988 ns)
std dev              296.4 ps   (247.2 ps .. 358.3 ps)
variance introduced by outliers: 62% (severely inflated)

benchmarking matrix tests/hmatrix inv
time                 908.5 ns   (901.3 ns .. 916.6 ns)
                     0.999 R²   (0.998 R² .. 0.999 R²)
mean                 934.0 ns   (917.6 ns .. 961.3 ns)
std dev              73.92 ns   (50.53 ns .. 108.6 ns)
variance introduced by outliers: 84% (severely inflated)

我的问题是:

1)速度是真实的还是由于基准测试过程中的工件?

2)如果加速是真的,是否有一个现有的库可以处理1x1,2x2,3x3,4x4矩阵作为特殊情况?

3)如果没有,那么包装HMatrix的最佳方法是什么,以便我们可以在矩阵很小时采用快速路径? ghc只能用一个构造函数解压缩记录。有没有办法自动生成我们代码的不同版本等。

示例-test.cabal:

name:                example-test
version:             0.1.0.0
build-type:          Simple
cabal-version:       >=1.10
executable example-test
  main-is:
    Main.hs
  build-depends:
    base >=4.7 && <4.8,
    criterion,
    hmatrix
  default-language:
    Haskell2010
  ghc-options:
    -H12G -O3 -optc-O3 -fllvm -rtsopts -threaded -fexcess-precision -j6 +RTS -N6 -RTS  -fno-ignore-asserts -fcontext-stack=150
    -- -fforce-recomp

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

HMatrix为标准密集线性代数(svd, 特征值,线性系统等)基于优秀和高度优化 BLAS / LAPACK库。

FFI调用,内存分配,错误检查导致开销, 代码以避免某些矩阵转置等。与此相比,这可以忽略不计 中等和大尺寸的典型矩阵计算所需的时间, 但对于非常小的数组和简单的操作,开销可能很大。

目前还没有重新实现小型阵列计算的计划。它是 不容易做事比BLAS / LAPACK好,而且我不确定是否有些速度 特定应用程序的获得比代码简单性更重要 一般性。

如果您的应用程序需要在2x2上执行大量简单操作, 或者3x3矩阵,那么其他库可能更适合这个 任务。

但我建议您在分析模式下运行程序以查找 真正的瓶颈。使用常数数据的基准可能不完全具有代表性 在“正常”计划中花费的时间。

即使您发现大部分时间花在那些小的计算上 矩阵,也许你可以使用等效矩阵重写算法 计算更大的维度。

答案 1 :(得分:0)

对于小向量和矩阵,通常使用线性包:https://hackage.haskell.org/package/linear