Question

我有两个文件存储文件名列表：

FileA:
GSM1328513
GSM1328514
GSM1328515
GSM1328516
GSM1328545
GSM1328546
GSM1328547
GSM1328548
GSM1328609
GSM1328610
GSM1328611
GSM1328612

and:
FileB:
    Brn
    Hrt
    Lng

我想要做的是，连接fileA中列出的每四个文件，并将连接文件命名为fileB中列出的文件名：要手动完成，它看起来像：

cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 > Brn
cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 > Hrt
cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 > Lng

由于我有很长的文件列表，我想自动完成，任何人都可以帮忙。如果有任何不清楚的地方，请指出。

Answer 1

没有sed的另一种快速方法：

cat FileA | while read a ; do read b ; read c ; read d ;
    echo "cat $a $b $c $d > " ; done | paste - FileB | bash

正如Didier Trosset所说，您可以跳过| bash以查看它在执行之前的作用。

其他方法：没有评估的单线程，将@dshepherd解决方案与我的结合：

cat FileA | xargs -n4 echo | paste - FileB | while read a b c d e ; do cat $a $b $c $d > $e ; done

优点：到目前为止，这是唯一一个不评估任何输出（| bash）并且不使用临时文件的内容，只使用在任何地方找到的标准工具（cat，{{ 1}}，xargs）。

Answer 2

以下是执行您要执行的操作的Shell脚本

iter=0
while read filename
do
    stop=`expr \( $iter + 1 \) \* 4`
    iter=`expr $iter + 1`
    files=`head -n $stop fileA | tail -n 4 | tr '\n' ' '`
    cat $files > $filename
done < fileB

Answer 3

另一种方法：您可以使用

轻松生成包含四个文件名的组

cat FileA | xargs -n4 echo

但是我想不出任何特别优雅的方法将它与FileB的输出文件名结合起来。一种可能性是进行一些字符串操作然后评估它（就像Didier Trosset的答案）。

编辑：搞定了！使用GNU parallel（就像类固醇上的xargs）：

parallel < tempA -n4 -k --files cat | paste - tempB | xargs -n 2 mv

parallel命令在每组4个参数上运行cat，并将输出放入临时文件中。它将这些临时文件的名称写入stdout（而-k表示它们以正确的顺序写出）。

paste将所需的文件名插入流中，然后我们只使用xargs -n 2 mv将临时文件移动到所需的位置。

我使用< tempA代替cat tempA，因为从技术上讲best practice。

这个（在我看来）优于其他一个衬垫的优点是你没有eval字符串（例如使用bash）。

Answer 4

使用awk：

awk '{ORS=(NR%4?" ":"\n")}1' FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB | bash

或者，使用dshepherd方法进行第一步：

xargs -n4 echo < FileA | awk '{print "cat "$0" >"}' | paste - FileB | bash

我发现这些非常干净，可扩展且符合逻辑。

最简单的方法（虽然方法不太通用，IMO少，＃34;漂亮＆＃34;），每个"cat"分组前置xargs，并附加> paste命令中的分隔符：

 xargs -n4 echo cat < FileA | paste -d ">" - FileB | bash

说明：

使用awk，将每组四行组成一行。如果记录编号RN为模4，则与新行"\n"分开，否则为单个空格" "。这给出了输出：

$ awk '{ORS=(NR%4?" ":"\n")}1' FileA
GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516
GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548
GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612

根据dshepherd的建议，使用xargs：

可以更轻松地完成此操作

$ xargs -n4 < FileA
GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516
GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548
GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612

现在，对于这些行中的每一行，前缀为cat并附加>。

$ xargs -n4 < FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' 
cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 > 
cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 > 
cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 >

使用FileB（paste - FileB表示从标准输入获取-来加入$ xargs -n4 < FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 > Brn cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 > Hrt cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 > Lng中的每一行。
```
bash
```
通过管道bash执行xargs -n4 < FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB | bash命令作为{{1}}命令执行每一行：
```
{{1}}
```

Answer 5

一个班轮：

cat FileA | sed 'N;N;N;s/\n/ /g;s/^/cat /;s/$/ >/;' | paste - FileB | bash

您可以通过删除最后一个管道bash来测试实际生成的命令。

对于FileA的每一行，获取接下来的三个N，将换行\n转换为空格，前置cat，然后追加{{ 1}}。然后将每个生成的行>与-中的一行合并。将这些命令发送到FileB。

更短的bash，在单个替换命令中添加sed和cat。

Answer 6

使用bash数组（需要bash 4或更高版本）。我也假设这个数字 fileB中的姓名与fileA中的姓名数相匹配。

readarray -t gsms < FileA
for ((i=0; i<${#gsms[@]}; i+=4)); do
    read fname
    echo "${gsms[@]:i:4}" > "$fname"
done < FileB

连接每四个文件，Linux

6 个答案: