Question

我有一组JPG图像，实际上是CT扫描切片，我想将其重建为DICOM图像文件并导入PACS。

我正在使用ClearCanvas，并设置了所有必需的标签（并通过使用专有应用程序将我的一个JPG文件转换为DICOM来确认它们，以确保它们是相同的）。我只是不确定我应该如何处理我的JPG文件以将其放入PixelData标签？

目前我正在根据ClearCanvas论坛的建议将其转换为Byte数组，但图像在DICOM查看器中只是乱码。我应该如何处理图像数据以使其成为可读格式？

    public DicomFile CreateFileFromImage(Image image)
    {
        int height = image.Height;
        int width = image.Width;
        short bitsPerPixel = (short)Image.GetPixelFormatSize(image.PixelFormat);

        byte[] imageBuffer = ImageToByteArray(image);
        DicomFile dicomFile = new DicomFile();
        dicomFile.DataSet[DicomTags.Columns].SetInt32(0, width);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.Rows].SetInt32(0, height);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.BitsStored].SetInt16(0, bitsPerPixel);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.BitsAllocated].SetInt16(0, bitsPerPixel);
        dicomFile.DataSet[DicomTags.HighBit].SetInt16(0, 7);
        //other tags not shown
        dicomFile.DataSet[DicomTags.PixelData].Values = imageBuffer;
        return dicomFile;
    }
    public static byte[] ImageToByteArray(Image imageIn)
    {
        MemoryStream ms = new MemoryStream();

        imageIn.Save(ms, System.Drawing.Imaging.ImageFormat.Jpeg);
        return ms.ToArray();
    }

Answer 1

ClearCanvas库作为两个辅助类，可以更轻松地对DicomFile内的像素数据进行编码和解码。它们是DicomCompressedPixelData类和DicomUncompressedPixelData类。您可以使用它们来设置图像的参数，并将它们编码到DicomFile对象中。

在您的情况下，由于您正在编码压缩对象，因此应使用DicomCompressedPixelData类。可以设置类上的属性。调用UpdateMessage方法会将这些属性值复制到DicomFile对象。此外，此类具有AddFrameFragment方法，可正确编码像素数据。请注意，压缩像素数据必须在每个数据帧周围具有一些特定的二进制包装器。这是您之前代码中缺少的部分。下面的代码显示了如何设置它。

        short bitsPerPixel = (short)Image.GetPixelFormatSize(image.PixelFormat);

        var dicomFile = new DicomFile();
        var pd = new DicomCompressedPixelData(dicomFile);

        pd.ImageWidth = (ushort)image.Width;
        pd.ImageHeight = (ushort) image.Height;
        pd.BitsStored = (ushort)bitsPerPixel;
        pd.BitsAllocated = (ushort) bitsPerPixel;
        pd.HighBit = 7;
        pd.SamplesPerPixel = 3;
        pd.PlanarConfiguration = 0;
        pd.PhotometricInterpretation = "YBR_FULL_422";

        byte[] imageBuffer = ImageToByteArray(image);
        pd.AddFrameFragment(imageBuffer);

        pd.UpdateMessage(dicomFile);

        return dicomFile;

Answer 2

我最终手动处理了位图，并在插件中的一些代码中创建了图像中红色通道的数组：

            int size = rows * columns;
            byte[] pData = new byte[size]; 
            int i = 0;

            for (int row = 0; row < rows; ++row)
            {
                for (int column = 0; column < columns; column++)
                {
                    pData[i++] = image.GetPixel(column, row).R;
                }
            }

它确实有效，但速度非常慢，并且会产生臃肿的DICOM文件。我很乐意让内置的DicomCompressedPixelData类正常工作。

非常欢迎任何进一步的建议。

Answer 3

在插入DICOM数据集之前，了解JPEG CT图像的位深度和颜色分量非常重要。它可以是8位有损（JPEG压缩处理2）或12位有损（JPEG压缩处理4）或8,12或16位无损灰度JPEG（JPEG压缩处理14-无损，非分层）。此信息对于更新像素数据相关信息至关重要，例如光度解释，每像素采样数，平面配置，分配位，高位传输语法。

使用ClearCanvas将JPG图像文件编码为DICOM PixelData

3 个答案: