在R中没有for循环的另一个data.frame中按条件选择行

时间:2014-08-23 02:38:31

标签: r

这与问题有关:How to extract rows (using Loop) from a data frame and save it in another data frame

如果' POS' ddf位于任何' start'之间。并且'结束' refdf,它需要包含在outdf中,它与ddf具有相同的结构。我可以用'来管理它。循环,但可以不使用'来实现。循环?

ddf = structure(list(POS = c(23L, 48L, 5L), Freq1 = c(0.5, 0.7, 0.8
), Freq2 = c(0.45, 0.55, 0.65)), .Names = c("POS", "Freq1", "Freq2"
), class = "data.frame", row.names = c(NA, -3L))

refdf = structure(list(Start = c(1L, 25L, 60L), End = c(10L, 50L, 75L
)), .Names = c("Start", "End"), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-3L))

ddf
#  POS Freq1 Freq2
#1  23   0.5  0.45
#2  48   0.7  0.55
#3   5   0.8  0.65

refdf
#  Start End
#1     1  10
#2    25  50
#3    60  75


outdf = data.frame(POS=numeric(), Freq1=numeric(), Freq2=numeric())
for(i in 1:nrow(ddf)) for(j in 1:nrow(refdf)){
      if(ddf[i,1]>refdf[j,1] &&  ddf[i,1]<refdf[j,2])
           {outdf[nrow(outdf)+1,] = ddf[i,]; next}
}
outdf
#  POS Freq1 Freq2
#2  48   0.7  0.55
#3   5   0.8  0.65

我试过以下但不起作用:

apply(ddf,1,function(x){print(x);ifelse(x[1]>refdf$Start & x[1]<refdf$End, x,"")})

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

对于大问题,这在空间上效率不高,但它不使用for

ddf[ddf$POS %in% unlist(apply(refdf, 1, function(x) seq(x[1],x[2]))),]
##   POS Freq1 Freq2
## 2  48   0.7  0.55
## 3   5   0.8  0.65

POS的所有允许值均由unlist(apply)表达式计算。这当然假设POS仅包含整数值。

答案 1 :(得分:1)

这是一种方式。它并不需要整数值,但它也不会特别有效:

pow <- cbind(expand.grid(ddf$POS, refdf$Start), Var3=expand.grid(ddf$POS, refdf$End)$Var2)

boom <- pow[which(pow$Var1 > pow$Var2 & pow$Var1 < pow$Var3), 'Var1']

ddf[ddf$POS %in% boom, ]
#  POS Freq1 Freq2
#2  48   0.7  0.55
#3   5   0.8  0.65