Question

这是我昨天问过的一个问题的补遗：Problems Sourcing in an R file into python using rpy2

在我的案例中，问题有两个问题。 @ MattDMo的解决方案（感谢Matt）调用.R脚本是正确的。但是，我认为我的错误是如何在python脚本中引用文件路径名，然后用于在.R文件中提供源。

在我的python脚本中，我有这个，

codeLoc = "../rcode"

接着是这个，

rpy.r.assign("codeLoc", codeLoc)

此assign函数将代码位置文件路径附加到我尝试输入的R脚本中的变量（“codeLoc”）。

最初，python脚本使用了这个：

rpy.r.source(codeLoc + "/filename.R")

真的很简单！但是现在rpy2做了一些东西，所以我必须使用字符串等。所以，知道

ro.r("""source('filename.R')""")

<。> .R脚本中的源代码，我如何将文件路径名称附加到脚本中，这样我就不必每次都调用它（因为我需要在几个不同的时间使用相同的文件路径，以及路径可能在未来发生变化）。基本上，我需要一个正确的这个伪代码的rpy2版本：

ro.r("""source(codeLoc + ('/filename.R')""")

我的预感是我可能需要改变使用rpy2分配codeLoc本身的方式？由于不正确使用assign方法，R和Python可能没有正确地相互通信？

提前致谢...

Answer 1

新的方式实际上让你的事情变得更轻松。您可以只指定字符串（如果需要，动态调用）并调用它，而不必调用r.assign。例如，

codeLoc = "../rcode"
r_call = "source('" + codeLoc + "/filename.R')"
ro.r(r_call)

修改如果您要打开一系列文件，可以在for循环中动态调用它们。我将讨论两种情况。首先，名称被索引（例如，filename1，filename2等），其次，它们没有被索引。

1）如果文件名的索引是ind_max是最大文件号，你可以source如下：

for num in range(ind_max): ro.r("source('" + codeLoc + "/filename" + str(num) + ".R')")

2）如果文件名没有编入索引，你可以通过定义你想要source的名字列表来做同样的事情：

names = ['spam', 'eggs'] for name in names: ro.r("source('" + codeLoc + "/filename" + name + ".R')")

然后使用rpy2分配然后在python中附加文件路径名

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