根据第二列中的匹配，我想要加入两个文本文件。 File1大于file2，包含file2中所有条目的匹配，以及许多不匹配。
加入工作，输出文件按预期加入匹配的条目。但是，我想保留file1中的不匹配条目，以便它们仍然出现在输出文件中。
这两个文件都是制表符分隔的。 File1有13列，file2有4.我在file1的第2列和file2的第1列之间进行匹配。
如何执行此操作，以使file1中不匹配的行仍出现在输出文件（file3）中？
我一直在使用以下代码（bash）：
join -t $'\t' -1 2 -2 1 -o 1.1,1.2,1.3,1.4,1.5,1.6,1.7,1.8,1.9,1.10,1.11,1.12,1.13,2.2,2.3,2.4 <(sort -k2,2 file1) <(sort -k1,1 file2) > file3
先谢谢你的帮助，我真的很感激！对于新手问题道歉，我是一名试图提高计算能力的生物学家，学习曲线陡峭。
此致
安东尼
答案 0 :(得分：2)
来自man join：
-a file_number
In addition to the default output, produce a line for each unpairable line in file file_number.
这似乎正是你想要的。
因此，既然您希望file1中的行也出现在输出中，请在命令中添加-a 1。
join -a 1 -t $'\t' -1 2 -2 1 -o 1.1,1.2,1.3,1.4,1.5,1.6,1.7,1.8,1.9,1.10,1.11,1.12,1.13,2.2,2.3,2.4 <(sort -k2,2 file1) <(sort -k1,1 file2) > file3