由于包/驱动程序Neo4j
(https://github.com/nicolewhite/Rneo4j),可以在R
内使用热门图表数据库RNeo4j
。
包裹作者@ NicoleWhite在several上提供了great examples GitHub的用法。
不幸的是,@ NicoleWhite提供的示例和文档有点过于简单,因为他们手动创建每个图节点及其关联的labels
和properties
,例如:
mugshots = createNode(graph, "Bar", name = "Mugshots", location = "Downtown")
parlor = createNode(graph, "Bar", name = "The Parlor", location = "Hyde Park")
nicole = createNode(graph, name = "Nicole", status = "Student")
addLabel(nicole, "Person")
当你处理一个微小的示例数据集时,这一切都很好,但这种方法对于像数千个用户的大型社交图这样的东西是不可行的,每个用户都是一个节点(这样的图形可能不会利用每个查询中的每个节点,但它们仍然需要输入到Neo4j
)。
我试图弄清楚如何使用矢量或数据帧来做到这一点。是否有解决方案,可能需要apply
语句或for
循环?
这个基本尝试:
for (i in 1:length(df$user_id)){
paste(df$user_id[i]) = createNode(graph, "user", name = df$name[i], email = df$email[i])
}
导致Error: 400 Bad Request
答案 0 :(得分:12)
作为第一次尝试,您应该查看我刚为事务端点添加的功能:
http://nicolewhite.github.io/RNeo4j/docs/transactions.html
library(RNeo4j)
graph = startGraph("http://localhost:7474/db/data/")
clear(graph)
data = data.frame(Origin = c("SFO", "AUS", "MCI"),
FlightNum = c(1, 2, 3),
Destination = c("PDX", "MCI", "LGA"))
query = "
MERGE (origin:Airport {name:{origin_name}})
MERGE (destination:Airport {name:{dest_name}})
CREATE (origin)<-[:ORIGIN]-(:Flight {number:{flight_num}})-[:DESTINATION]->(destination)
"
t = newTransaction(graph)
for (i in 1:nrow(data)) {
origin_name = data[i, ]$Origin
dest_name = data[i, ]$Dest
flight_num = data[i, ]$FlightNum
appendCypher(t,
query,
origin_name = origin_name,
dest_name = dest_name,
flight_num = flight_num)
}
commit(t)
cypher(graph, "MATCH (o:Airport)<-[:ORIGIN]-(f:Flight)-[:DESTINATION]->(d:Airport)
RETURN o.name, f.number, d.name")
在这里,我形成一个Cypher查询,然后遍历数据帧并将值作为参数传递给Cypher查询。您现在的尝试速度很慢,因为您要为创建的每个节点发送单独的HTTP请求。通过使用事务端点,您可以在单个事务下创建多个内容。如果您的数据框非常大,我会将其分解为每个事务大约1000行。
作为第二次尝试,您应该考虑在neo4j-shell中使用LOAD CSV。