使用awk对类似行的求和值

Question

从下面的示例中，我想总结Targets和miRNA相似的行的得分：请参阅下文。

 Target       miRNA                 Score
 NM_198900    hsa-miR-423-5p       -0.244
 NM_198900    hsa-miR-423-5p       -0.6112
 NM_1989230   hsa-miR-413-5p       -0.644
 NM_1989230   hsa-miR-413-5p       -0.912

输出：

NM_198900      hsa-miR-423-5p       -0.8552
NM_1989230     hsa-miR-413-5p       -1.556

Answer 1

像这样：

awk '{x[$1 " " $2]+=$3} END{for (r in x)print r,x[r]}' file

当它看到每一行时，它将第三个字段（$3）添加到数组x[]中，并通过连接字段1和2以及它们之间的空格来索引。最后，它会打印x[]的所有元素。

按照@ jaypal的建议，您可能更喜欢保留标题行（NR == 1）并使用TAB作为输出字段分隔符

awk 'NR==1{OFS="\t";print;next} {x[$1 OFS $2]+=$3} END{for (r in x)print r,x[r]}' file