Question

我在Ubuntu 14.04.1上运行R 3.0.2。我已经安装了rJava软件包，但如果我用sudo启动它，我只能在R / RStudio中使用它。如果我单击应用程序启动器，或者只是在命令行中输入R，则在加载rJava库时会出现以下错误：

> library(rJava)  
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
    call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
    error: unable to load shared object '/usr/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
    libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or director  
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’

但是，如果我输入＆＃39; sudo rstudio＆＃39;或者＆＃39; sudo R＆＃39;在终端中，rJava加载没有问题。有人知道我做错了吗？

可能相关的问题：我通过输入

安装了rJava

sudo apt-get install r-cran-rjava

在命令提示符下;安装正常的方式：

apt-get install r-cran-rjava

对我不起作用，也没有在R中安装（没有使用sudo启动它）。当我尝试以这种方式安装时，遇到了与this question中解决的问题相同的问题。

Answer 1

除root之外的任何用户都可能无法读取文件/usr/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so。您可以通过以下方式检查：

ls -l /usr/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so

如果输出为rw-------或rw-rw----，那么简单的用户就无法读取它。您可以使用chmod命令更正此问题：

chmod -R a+rX /usr/lib/R/site-library/rJava/

Answer 2

我尝试了此处列出的解决方案无济于事。在Ubuntu 14.04上运行的是在/ usr / lib中创建到libjvm.so的软链接。

ln -s /usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server/libjvm.so /usr/lib

Answer 3

在启动R：

之前，您需要取消设置JAVA_HOME环境变量

 unset JAVA_HOME

Answer 4

从Rscript运行时看到这个问题。 Sudo工作，Rscript用户没有。我首先按照damienfrancois的建议做了chmod -R a + rX，但这没有用。然后我尝试取消设置JAVA_HOME，正如Gon建议的那样。这有效（或者可能与chmod结合使用）。

如果我用sudo启动R，R包rJava只会加载

4 个答案: