NetworkX - 创建属于4节点集团的所有节点的新图形

Question

我有一个网络，我想受集团约束，但我还没有弄清楚如何正确地做到这一点。我能够使用k-cores执行相同的过程，但不确定创建仅包含clique的图形的正确过程。

我希望如果我使用k_core函数显示查找子图的过程，有人可以帮我改变我的过程以使用clique函数查找子图。

首先，我创建一个图表，我将使用空手道俱乐部：

In [1]: import networkx as nx

In [2]: g = nx.karate_club_graph()

在iPython中绘制图表：

In [3]: pylab inline
Populating the interactive namespace from numpy and matplotlib

In [4]: nx.draw(g)

接下来，我找到4核内的所有边（有4个或更多边）：

In [5]: g_4k_edges = nx.k_core(g, k=4).edges()

将这些边添加到新图表中：

In [6]: g_4k = nx.Graph()
In [7]: g_4k.add_edges_from(g_4k_edges)

绘制4核图：

In [8]: nx.draw(g_4k)

有关如何执行此操作的任何想法，但不使用k核来绑定网络，而是使用具有4个或更多顶点的派系？

Answer 1

以下是使用派系生成子图的一种方法。

import networkx as nx

g = nx.karate_club_graph()

查找4个或更多节点的所有派系：

cliques = nx.find_cliques(g)
cliques4 = [clq for clq in cliques if len(clq) >= 4]

从所有足够大的派系中创建g的子图：

nodes = set(n for clq in cliques4 for n in clq)
h = g.subgraph(nodes)

删除h的度数小于4的节点：

deg = nx.degree(h)
nodes = [n for n in nodes if deg[n] >= 4]

所需的图表k是h的子图，包含以下节点：

k = h.subgraph(nodes)

这是所需图表的图像：

nx.draw(k)