Question

我知道已经提出了类似的问题，但我无法根据我的具体情况调整以前的答案，所以我非常感谢任何帮助。

我在Windows中使用以下代码，它完全正常。

try
{
Process protSpec = Runtime.getRuntime().exec(new String[]{"cmd", "/c", "obspectrophore -i Rv0001.fasta > Rv0001.spec" });
            protSpec.waitFor();
}
catch (Exception e1)
{
System.out.println(e1.toString());
e1.printStackTrace();
}

尝试将其改编为Linux，我剪切了上面代码的“cmd”，“/ c”以获得

    try
    {
    Process protSpec = Runtime.getRuntime().exec(new String[]{"obspectrophore -i Rv0001.fasta > Rv0001.spec" });
                protSpec.waitFor();
    }
    catch (Exception e1)
    {
    System.out.println(e1.toString());
    e1.printStackTrace();
    }

现在我收到错误消息

java.io.IOException: Cannot run program "obspectrophore -i Rv0001.fasta > Rv0001.spec": java.io.IOException: error=2, No such file or directory

任何解决这个问题的想法都将不胜感激。提前谢谢！

Answer 1

在环境中设置obspectrophore，以便可以从任何目录访问它，并确保用户具有执行权限。

Answer 2

cmd /c的Linux等效项为sh -c。在这种情况下，命令语法是相同的：

Runtime.getRuntime().exec(new String[]{
    "sh", "-c", "obspectrophore -i Rv0001.fasta > Rv0001.spec" 
});

您尝试过的Linux命令没有通过命令解释器运行命令，这就是它失败的原因（这相当于将Java代码粘贴到DOS提示符中，希望DOS能够解决并运行它）。

Runtime.getRuntime（）。exec适用于Linux

2 个答案: