合并来自R中多个目录的多个.txt文件

时间:2014-08-06 18:09:00

标签: r merge dataframe rstudio dir

合并来自不同子目录的.txt文件

我有一个文件夹,里面装满了过去日期的子文件夹(例如01_14),在每个日期文件夹中有11个文件名为01.txt,02.txt ...如何合并所有.txt文件在一个数据框中,一列是从哪里来的文件夹的名称,另一列是文件名来自哪里?

我的层次结构看起来像这样:

\Data
     \01_14
           01.txt
           02.txt
           ...
           11.txt 
     \02_14
           01.txt
           02.txt
           ...
           11.txt 
     \03_14
           01.txt
           02.txt
           ...
           11.txt 

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

当我需要读取多个文件时,我使用read.stack辅助函数,它基本上是read.table的包装器,但它允许您在每个文件的基础上添加额外的列。以下是我如何在您的方案中使用它。

dir<-"Data"

subdir<-list.dirs(dir, recursive=F)

#get dir/file names
ff<-do.call(rbind, lapply(subdir, function(x) {
    ff<-list.files(x, "\\.txt$", include.dirs = FALSE, full.names = TRUE)
    data.frame(dir=basename(x), file=basename(ff), 
        fullpath=ff, stringsAsFactors=F)
}))

#read into data.frame
read.stack(ff$fullpath, extra=list(file=ff$file, dir=ff$dir))

答案 1 :(得分:0)

试试这个:

fileNames <- list.files("Data", recursive = TRUE, full.names = TRUE)
fileContents <- lapply(fileNames, function(fileName) 
  paste(readLines(fileName, warn = FALSE), collapse = "\n"))
meta <- regmatches(fileNames, regexec(".*Data/(.*)/(.*)$", fileNames))
merged <- mapply(c, fileContents, lapply(meta, "[", -1), SIMPLIFY = FALSE)
as.data.frame(t(do.call(cbind, merged)))