使用Matlab将uint16 tiff图像保存为truecolor

Question

我正在处理tiff格式的显微镜图像（在Matlab中），通常是uint8或uint16。基本上我读它们，把它们放在一个单元格数组中进行处理，然后以tiff格式导出它们作为图像序列或堆栈（使用imwrite和＆＃39;覆盖＆＃39;或者＆＃39;追加＆＃ 39; imwrite的writemode属性，分别）。到目前为止，一切都运作良好。

我遇到的问题如下：

当我用ImageJ打开图像时，它们不是真正的颜色＆＃34; RGB＆＃34;颜色模式，而是复合模式。例如，ImageJ将数据读取为8位，但它不会将图像打开为真彩色（很抱歉，选择不好的单词我不知道正确的术语）。因此，我必须手动将3个通道组合在一起，这对于大型数据集来说是很麻烦的。

这是一个屏幕截图解释。在左边是我想要的，即。如果我直接使用ImageJ打开图像，我得到的是右边是我用Matlab保存图像并用ImageJ打开它后我现在所拥有的，这是我不想要的。

我用于导出图像序列的代码如下。 ＆＃34; FinalSequenceToExport＆＃34;是包含图像的单元格数组。

for i = 1:SliceNumber
    ExportedName = sprintf('%s%s%d.tiff',fileName,'Z',i);
  imwrite(FinalSequenceToExport{i},ExportedName,'tif','WriteMode','overwrite','Compression','none');

end

• 例如，如果我向Matlab询问FinalSequenceToExport {1}的大小，它会给出512 x 512 x 3。
• 如果我在命令窗口中打开一个给定的图像，然后使用与上面相同的代码保存它，它会按照我想要的方式执行，并在ImageJ中打开生成的图像。因此，我的猜测是问题来自使用细胞阵列，但我不明白如何。

我希望我已经足够清楚了。如果没有，请询​​问更多详情。 谢谢你的帮助！

Answer 1

您需要指定'ColorSpace'

试试这个

imwrite(FinalSequenceToExport{i},ExportedName,...
       'tif','WriteMode','overwrite','Compression','none', ...
       'ColorSpace', 'rgb');

Answer 2

在重新审视这个问题后，我发现以下内容有效，感谢来自@Ashish的提示：

imwrite(uint8(FinalSequenceToExport{i}/255),...);

转换为uint8后，我只需要除以255。