Question

我正在使用HDF5Store，在分析之前存储我的一些处理结果。进入商店我想提出3种类型的结果，

原始结果，完全没有处理过，只是从原始CSV格式读入并合并
从原始结果派生的处理结果，有一些处理和划分为更多逻辑分组
添加了有用的夏季列并删除了冗余列的汇总结果，以便于阅读。

我认为使用Hierarchical Keys的HDF5Store会做到这一点，一个用于Raw，一个用于Processed，一个用于Summarized。

我想要一个像：

这样的结构

<class 'pandas.io.pytables.HDFStore'>
File path: results.h5
/proccessed/dbn_reinit                           frame        (shape->[22880,19])
/proccessed/dbn_rerep_code                       frame        (shape->[11440,18])
/proccessed/dbn_rerep_enhanced_input             frame        (shape->[11440,18])
/proccessed/linear_classifier                    frame        (shape->[572,18])  
/proccessed/msda_rerep_code                      frame        (shape->[18304,17])
/proccessed/msda_rerep_enhanced_input            frame        (shape->[18304,17])
/raw/dbn_reinit                                  frame        (shape->[22880,15])
/raw/dbn_rerep                                   frame        (shape->[23452,15])
/raw/msda_rerep                                  frame        (shape->[36608,14])
/summerised/dbn_reinit                           frame        (shape->[22880,10])
/summerised/dbn_rerep_code                       frame        (shape->[11440,9]) 
/summerised/dbn_rerep_enhanced_input             frame        (shape->[11440,9]) 
/summerised/linear_classifier                    frame        (shape->[572,6])   
/summerised/msda_rerep_code                      frame        (shape->[18304,10])
/summerised/msda_rerep_enhanced_input            frame        (shape->[18304,10])

我希望我能说：

store = pandas.HDF5Store('results.h5')
store.add_group('raw')
raw_store = store['raw'] 
raw_store['dbn_reinit'] = dbn_reinit_dataframe
raw_store['dbn_rerep_code'] = dbn_rerep_code_dataframe
...

等

然而，似乎并不是一种获取商店子组并使用它的方法，因为它是商店，

所以我不得不这样做：

store = pd.HDFStore('results.h5', mode='w')

store['raw/dbn_reinit'] = dbn_reinit_dataframe
store['raw/dbn_rerep'] = dbn_reinit_dataframe
...

这是罗嗦的，并没有真正显示任何类型的结果分组到3个类别我错过了什么吗？或者是HDF的Hieratrchical特征，只写一些包含/ s的长键名吗？

Answer 1

使用分层键的文档是here。 .remove()具有此类功能，您可以在该级别删除树中的节点。

您可以执行：store.get_storer('foo')返回包含对节点的访问权限的对象。（例如.group）。但是，此对象不允许您添加/选择子节点，也不提供该节点的良好repr。

您可以在github上为这些功能添加功能请求。请提供您认为应该做的可重复的示例。

欢迎提出请求！

我很少使用多个组。主要是因为使用不同文件的灵活性。你可以做你想做的事情，我从来没有找到它的需要（例如把你的团体视为文件本身）。 HDF5不是数据库，所以这很少有用

如何读/写HDF5商店中的子组？

1 个答案: