我有一个脚本需要在文件夹中的每个文件上运行。 该脚本将在新文件夹中创建一个与原始文件同名的新文件。
因此该文件夹包含名称如下的文件:
SLX-8691.ART12.seq
SLX-8690.ART12.seq
SLX-8692.ART12.seq
SLX-8693.ART12.seq
我想在每个文件上运行的脚本是示例如下:
$ ./unique_seq_counts.rb ./qualitymask/SLX-8691.ART12.seq > ./uniquecounts/SLX-8691.ART12.counts.txt
这样SLX-8691.ART12.seq将被每个文件名替换。
有没有办法循环替换每个文件名?
由于
答案 0 :(得分:1)
使用循环:
for F in ./qualitymask/*.seq; do
T=${F##*/} ## Removes directory part. Same as $(basename "$F")
T=${T%.seq}.counts.txt ## Removes .seq and adds .counts.txt
./unique_seq_counts.rb "$F" > "./uniquecounts/$T"
done