grep - 匹配单词，之后没有任何内容

Question

我有一个以下格式的文件（数千行＆amp; tab分隔）：

Gnl3l   3'UTR    
Smap1   5'UTR||3'UTR    
D4Wsu53e    CDS||5'UTR||3'UTR    
Mecp2   3'UTR    
Mecp2   3'UTR

我想从第二个标签返回仅包含"3'UTR"的所有行。期望的输出：

Gnl3l   3'UTR    
Mecp2   3'UTR    
Mecp2   3'UTR

有关grep /正则表达式的任何想法吗？

Answer 1

最好在这里使用awk，因为使用awk可以轻松匹配特定字段而无需使用复杂的正则表达式：

awk -v s="3'UTR" '$2==s' file
Gnl3l   3'UTR
Mecp2   3'UTR
Mecp2   3'UTR

但是这里有一个grep命令也可以，但我更喜欢awk：

grep "\t3'UTR" file
Gnl3l   3'UTR
Mecp2   3'UTR
Mecp2   3'UTR

Answer 2

如果您想在此处使用正则表达式，请使用以下内容：

grep "(.*)\t3'UTR$"

此正则表达式表示开头可以有任何内容（(.*)），后跟一个标签（\t - 您还可以使用所有空格\s）和{{1 }}。之后，该行必须结束（3'UTR）。

请注意，不需要$，但如果您想使用远离grep的正则表达式，您将找到需要它的环境。

Answer 3

使用grep：

grep -E "^\S+\s+3'UTR$" file

或者

grep "^[^\t]\+\t\+3'UTR$" file

输出：

Gnl3l   3'UTR
Mecp2   3'UTR
Mecp2   3'UTR