链接fftw库以进行pyFFTW安装时出错

Question

我尝试将pyFFTW 0.9.2安装到OSX mavericks，但我遇到以下错误：

/usr/bin/clang -bundle -undefined dynamic_lookup
-L//anaconda/lib -arch x86_64 -arch x86_64 
build/temp.macosx-10.5-x86_64-2.7/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pyFFTW-master/pyfftw/pyfftw.o 
-L//anaconda/lib -lfftw3 -lfftw3f -lfftw3l -lfftw3_threads -lfftw3f_threads -lfftw3l_threads 
-o build/lib.macosx-10.5-x86_64-2.7/pyfftw/pyfftw.so

ld: library not found for -lfftw3

clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)

如pyFFTW installation -> cannot find -lfftw3_threads中所述，我尝试编译并安装fftw 3.3.4三次。但这对我不起作用。

我是怎么做的：

./configure --enable-float --enable-share  => make => make install
./configure --enable-long-double --enable-share  => make => make install
./configure --enable-threads --enable-share  => make => make install

然后我在pyFFTW文件夹中运行python（2.7）安装文件，我得到上面的错误。

感谢您的帮助。

Answer 1

我在OSX 10.9.4 Maverick上遇到了同样的问题。 试试这个： 下载FFTW 3.3.4而不是打开一个终端窗口并进入提取的FFTW目录并运行这些命令：

$ ./configure --enable-long-double --enable-threads
$ make
$ sudo make install
$ ./configure --enable-float --enable-threads
$ make
$ sudo make install

按照建议使用pip安装pyFFTW：

$ sudo pip install pyfftw

Answer 2

我正在使用通过conda安装的MacOX 10.11.4和Python 3.5.1，上述答案对我不起作用。

我仍然会收到此错误：

ld: library not found for -lfftw3l
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
error: command 'gcc' failed with exit status 1

----------------------------------------
Failed building wheel for pyfftw

或：

ld: library not found for -lfftw3l_threads
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
error: command 'gcc' failed with exit status 1

----------------------------------------
Failed building wheel for pyfftw

为我工作的内容与我发现的内容略有不同here：

首先安装long-double库

comp:fftw-3.3.4 user$ ./configure --enable-threads --enable-shared --disable-fortran --enable-long-double CFLAGS="-O3 -fno-common -fomit-frame-pointer -fstrict-aliasing"
comp:fftw-3.3.4 user$ make
comp:fftw-3.3.4 user$ sudo make install

然后安装float和double库

comp:fftw-3.3.4 user$ ./configure --enable-threads --enable-shared --disable-fortran --enable-sse2 --enable-float CFLAGS="-O3 -fno-common -fomit-frame-pointer -fstrict-aliasing"
comp:fftw-3.3.4 user$ make
comp:fftw-3.3.4 user$ sudo make install
comp:fftw-3.3.4 user$ ./configure --enable-threads --enable-shared --disable-fortran --enable-sse2 CFLAGS="-O3 -fno-common -fomit-frame-pointer -fstrict-aliasing"
comp:fftw-3.3.4 user$ make
comp:fftw-3.3.4 user$ sudo make install

然后安装pyfftw

comp:fftw-3.3.4 user$ sudo -H  pip install pyfftw

我不认为--disable-fortran和--enable-sse2标志是必要的，我不确定sudo是否需要pip，但这对我有用。

请注意，完成后，/usr/local/lib文件夹应包含以下文件：

libfftw3.3.dylib
libfftw3.a
libfftw3.dylib
libfftw3.la
libfftw3_threads.3.dylib
libfftw3_threads.a
libfftw3_threads.dylib
libfftw3_threads.la
libfftw3f.3.dylib
libfftw3f.a
libfftw3f.dylib
libfftw3f.la
libfftw3f_threads.3.dylib
libfftw3f_threads.a
libfftw3f_threads.dylib
libfftw3f_threads.la
libfftw3l.3.dylib
libfftw3l.a
libfftw3l.dylib
libfftw3l.la
libfftw3l_threads.3.dylib
libfftw3l_threads.a
libfftw3l_threads.dylib
libfftw3l_threads.la