再次更新
我试图创建一些简单的方法来重现这一点,但还没有成功。
到目前为止,我已尝试过各种简单的数组分配和操作,但它们都抛出了一个MemoryError,而不仅仅是SIGKILL崩溃。
例如:
x =np.asarray(range(999999999))
或:
x = np.empty([100,100,100,100,7])
按原样抛出MemoryErrors。
我希望有一种简单的方法可以在某些时候重新创建它。
结束更新
我有一个运行numpy / scipy的python脚本和一些自定义C扩展。
在Virtual Box下的Ubuntu 14.04上,它运行完成就好了。
在Amazon EC2 T2微型实例上,它使用输出终止(运行一段时间):
终止
在python调试器下运行,信号没有被捕获,调试器也退出。
在strace下运行,我得到:
munmap(0x7fa5b7fa6000, 67112960) = 0
mmap(NULL, 67112960, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7fa5b7fa6000
mmap(NULL, 67112960, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7fa5affa4000
mmap(NULL, 67112960, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7fa5abfa3000
mmap(NULL, 67637248, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7fa5a7f22000
mmap(NULL, 67637248, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7fa5a3ea1000
mmap(NULL, 67637248, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7fa59fe20000
gettimeofday({1406518336, 306209}, NULL) = 0
gettimeofday({1406518336, 580022}, NULL) = 0
+++ killed by SIGKILL +++
在尝试捕获" SIGKILL"时在gdb下运行,我得到:
[Thread 0x7fffe7148700 (LWP 28022) exited]
Program terminated with signal SIGKILL, Killed.
The program no longer exists.
(gdb) where
No stack.
运行python的跟踪模块(python -m trace --trace),我得到:
defmatrix.py(292): if (isinstance(obj, matrix) and obj._getitem): return
defmatrix.py(293): ndim = self.ndim
defmatrix.py(294): if (ndim == 2):
defmatrix.py(295): return
defmatrix.py(336): return out
--- modulename: linalg, funcname: norm
linalg.py(2052): x = asarray(x)
--- modulename: numeric, funcname: asarray
numeric.py(460): return array(a, dtype, copy=False, order=order)
我现在无法想到任何其他事情来弄清楚发生了什么。
我怀疑它可能内存不足(它是一个AWS Micro实例),但我无法弄清楚如何确认或否认这一点。
是否有其他可以使用的工具可以帮助确定程序停止的确切位置? (或者我正在以错误的方式运行上述工具之一?)
Amazon EC2 T2微型实例默认没有定义交换空间,所以我添加了一个4GB的交换文件,并且能够运行该程序。
然而,我仍然对一种运行程序的方式非常感兴趣,以至于它终止了一些消息更接近"没有足够的内存"而不是" Killed"
如果有人有任何建议,我们将不胜感激。
答案 0 :(得分:6)
听起来你已经遇到了可怕的Linux OOM Killer。当系统完全运行内存不足并且内核绝对需要分配内存时,它会终止进程而不是崩溃整个系统。
查看系统日志以确认此信息。一行类似于:
kernel: [884145.344240] mysqld invoked oom-killer:
之后的某个时间:
kernel: [884145.344399] Out of memory: Kill process 3318
应该存在(在这个例子中,它具体提到了mysql)
您可以将这些行添加到/etc/sysctl.conf
文件中,以有效禁用OOM杀手:
vm.overcommit_memory = 2
vm.overcommit_ratio = 100
然后重启。现在,原始的,内存饥饿的进程应该无法分配内存,并且希望抛出适当的异常。
设置overcommit_memory
意味着Linux不会过度提交内存,这意味着如果没有足够的内存,内存分配将会失败。请参阅此答案,详细了解overcommit_ratio
的效果:https://serverfault.com/a/510857