Question

我正在尝试在R中安装软件包，但在下载后，加载软件包库将无法运行 - 运行require("<package_name>")或library("<package_name>")时出现错误：

库中的错误（“package_name”）：没有名为'package_name'的包

我在Ubuntu 14.04.1上运行R 3.0.2，它安装在os x mavericks内部运行的流浪虚拟机中。

我尝试重新安装所有内容（R，Ubuntu，sudo apt-get --reinstall install r-base-dev）。我试过以root身份运行R，但都无济于事。

我发现了另外两个关于这个问题的说法：

Ubuntu 12.04 R install.packages() does not work. No warning, no install

install.packages() Rstudio server AWS ubuntu error

并尝试了建议的解决方案，但它们都不适用于我。

关于我的安装程序的更多背景知识;这是我用来在ubuntu中安装R的命令序列：

    sudo apt-get update
    echo "deb http://http://ftp.osuosl.org/pub/cran/bin/linux/ubuntu trusty/" >> ./sources.list.appendme
    sudo cat /etc/apt/sources.list ./sources.list.appendme  > ./sources.list.tmp
    sudo mv ./sources.list.tmp /etc/apt/sources.list
    rm ./sources.list.appendme
    sudo apt-get install r-base
    sudo apt-get install r-base-dev
    sudo apt-get --reinstall install r-base-dev

这遵循此处的说明：http://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/README用于在Ubuntu中安装R.

以下是我用来制作虚拟机的安装步骤：

> vagrant box add july24
> https://cloud-images.ubuntu.com/vagrant/trusty/current/trusty-server-cloudimg-i386-vagrant-disk1.box
> vagrant init july24 vagrant up

以下是我在OS X R安装中运行软件包安装所获得的输出与我的Ubunutu R安装的比较。有趣的是，在Ubunutu尝试中下载的包大小通常要小得多（OS X的R中为47KB和26KB，而Ubuntu R中为14KB和0.9257KB）。不确定这是R版本（OS X / Ubunutu中的3.0.3 / 3.0.2）之间的区别，还是因为不同操作系统的不同需求...

OS X中正确，无错误的软件包安装：

install.packages("dataview",repos="http://cran.cs.wwu.edu")


还要安装依赖项'xtermStyle'

尝试访问网址   'http://cran.cs.wwu.edu/bin/macosx/contrib/3.0/xtermStyle_2.2-4.tgz'   内容类型'application / x-gzip'长度为49060字节（47 Kb）   网址   ==================================================下载了47 Kb

尝试访问网址   'http://cran.cs.wwu.edu/bin/macosx/contrib/3.0/dataview_2.0-9.tgz'   内容类型'application / x-gzip'长度为27032字节（26 Kb）   网址   ==================================================已下载26 Kb

下载的二进制包在   的/ var /文件夹/ SY / w_z0czvs2nqd2ys0vf_827zc0000gn / T // RtmpOlT9rM / downloaded_packages


library('dataview')


加载必需的包：xtermStyle

在Ubuntu中安装错误：

install.packages("dataview",repos="http://cran.cs.wwu.edu")


将软件包安装到'/home/vagrant/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0'（作为'lib'是   未指定）还安装依赖项'xtermStyle'

尝试访问网址   'http://cran.cs.wwu.edu/src/contrib/xtermStyle_2.2-4.tar.gz'内容   键入'application / x-gzip'长度15265字节（14 Kb）打开的URL   ==================================================下载了14 Kb

尝试网址“http://cran.cs.wwu.edu/src/contrib/dataview_2.0-9.tar.gz”   内容类型'application / x-gzip'长度为9257字节，打开URL   ==================================================下载了9257字节

下载的源包在   “/ TMP / RtmppaTkT7 / downloaded_packages”


library('dataview')


库中的错误（“dataview”）：没有名为'dataview'的包


library('dataview',lib.loc='/home/vagrant/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0')


库中的错误（“dataview”，lib.loc =“/ home / vagrant / R / i686-pc-linux-gnu-library / 3.0”）：
  没有名为'dataview'的包

也许有些东西我不见了？非常感谢您的帮助或建议。

Answer 1

好的，所以我遇到了同样的问题......请确保为VM分配足够的内存。 Vagrant的默认虚拟机内存为512米...将其增加到2048米，一切正常......

我在我的vagrant文件中使用它来增加内存：

  config.vm.provider "virtualbox" do |vb|
    # Use VBoxManage to customize the VM. For example to change memory:
    vb.customize ["modifyvm", :id, "--memory", "2048"]
  end

Answer 2

是Ben B，这是关键。
虽然，需要稍微修改才能解决一些错误：不确定我的配置是如何不同的，但这是Vagrantfile的添加实际上最终会有效：

config.vm.provider :virtualbox do |virtualbox|
  # allocate 1024 mb RAM
  virtualbox.customize ["modifyvm", :id, "--memory", "2024"] 
end

我的流浪装置现在非常基本 - 几乎使用所有默认选项。也许这就是为什么工作解决方案有点不同......

Answer 3

我不确定您为何通过虚拟机运行R.您可以在OS X或Ubuntu上运行R.但是，我要采取的第一步是下载RStudio;它是R的IDE。从那里你应该能够在IDE中根据需要下载软件包。

 install.packages('testthat')

R install.packages（）不适用于ubuntu vagrant vm

3 个答案: