建立数以百万计的多对多关系

时间:2014-07-24 14:55:00

标签: python data-structures sqlite

我在python sqlite3数据库中有以下信息,该数据库有大约400万条记录。

Term         No of articles      Article Ids
Obama           300            [411,523,534, …. 846]
Gandhi         3900            [23,32,33…..4578]
Mandela        3900            [21,14,56,145 …4536]
George Bush     450            [230,310 … 700]
Tony Blair      350            [225,320 … 800]
Justin Bieber   25             [401 , 420, 690 …. 904]
Lionel Messi    150            [23, 78, …… 570]

'Article Ids'是一个包含id列表的blob(由API返回)

我的任务是从Id列表中为每个术语查找common-id并将它们保存在'relationships.db'中

如何建立关系,我发现哪些文章都涉及甘地和曼德拉在一起(相交文章ID)?

relationships.db应如下所示;

Term 1              Term 2          No of Common Article Ids    Common Article IDS
Obama               Gandhi                17                    [34,123,25 ...]
Obama               Mandela               43                    [145,111,234,456 ....]
Obama               George Bush           46
Obama               Tony Blair             2
Obama               Justin Bieber         36
Obama               Lionel Messi           3
Gandhi              Mandela               40
Gandhi              George Bush           41
Gandhi              Tony Blair            32
Gandhi              Justin Bieber         31
Gandhi              Lionel Messi          20
Mandela             George Bush           20
Mandela             Tony Blair            11
Mandela             Justin Bieber         19
Mandela             Lionel Messi          39
George Bush         Tony Blair            46
George Bush         Justin Bieber         49
George Bush         Lionel Messi           2
Tony Blair          Justin Bieber         50
Tony Blair          Lionel Messi           3
Justin Bieber       Lionel Messi           6

使用'for循环'遍历每个术语以获得交集是痛苦的。有没有一种有效的方法来做到这一点? “记忆”和“速度”之间会有权衡吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

评论暗示了这一点,但是当信息仍在BLOB中时,处理信息是不可能的(或者至少是非常困难的)。如果重组数据库,可以取得更多进展:

Term      Article_id
Ghandi    33
Obama     411
Obama     523
Ghandi    23
Obama     846
...
Mandela   23

这种“扁平”表示具有一些优点。首先,它使得添加新文章变得容易,您不必提取blob。其次,通过适当的索引,您可以轻松恢复原始计数:

SELECT COUNT(*) FROM news WHERE Term="Ghandi"`

如果需要,可以将它们存储在单独的表中。要提取联合文章,您可以搜索以下内容:

SELECT A.Article_id, A.Term, B.Term FROM news AS A 
JOIN news AS B ON A.Article_id = B.Article_id 
AND A.Term != B.Term

请注意,这会重复计算,但这很容易纠正。这是一个完整的最小工作示例,其中包含一个修改过的表格以显示更多匹配项:

import sqlite3

conn = sqlite3.connect(":memory:")

raw_items = '''
Ghandi    33
Obama     411
Obama     521
Ghandi    23
Obama     21
Ghandi    411
Mandela   21'''

script = '''
CREATE TABLE news ( 
Term STRING,
Article_id INTEGER
);'''

conn.executescript(script)
items = [line.split() for line in raw_items.strip().split('\n')]
conn.executemany("INSERT INTO news VALUES (?,?)", items)

cmd = '''SELECT COUNT(*) FROM news WHERE Term="Obama"'''
print "Obama size: ", conn.execute(cmd).fetchone()

cmd = '''
SELECT A.Article_id, A.Term, B.Term FROM news AS A 
JOIN news AS B ON A.Article_id = B.Article_id 
AND A.Term != B.Term '''

for result in conn.execute(cmd).fetchall():
    print result

这给出了:

Obama size:  (3,)
(411, u'Obama', u'Ghandi')
(21, u'Obama', u'Mandela')
(411, u'Ghandi', u'Obama')
(21, u'Mandela', u'Obama')

答案 1 :(得分:1)

您可以找到pandas的一些解决方法。

1)使用pandas.read_sql

创建一个pandas DataFrame

2)然后你可以得到像@logc

建议的交叉连接

3)之后,您可以将列表转换为集合并应用交集。

如果你需要帮助来实施,我现在有点匆忙帮助你。

编辑:

好的,确实非常简单,但我不知道它是否具备您所需的性能,也许您需要逐步阅读csv文件:

import pandas, sqlite3

conn = sqlite3.connect(databaseFilePath)
df=pandas.read_sql('SELECT * FROM Terms;',conn)
df['Article Ids'] = df['Article Ids'].apply(eval).apply(set)
df['key'] = False
df2 = pandas.merge(df,df,on='key')
df2 = df2[df2.Term_x!=df2.Term_y]
df2['Common Articles IDS'] = df2.apply(lambda row:set.intersection(row['Article Ids_x'], row['Article Ids_y']), axis=1)
df2['No of Common Articles Ids'] = df2['Common Articles IDS'].apply(len)
df2['Common Articles IDS'] = df2['Common Articles IDS'].apply(list).apply(str)
df2[['Term_x','Term_y', 'No of Common Articles Ids', 'Common Articles IDS']].to_sql(outputTableName, conn)