在Ubuntu中更改R Studio中的默认安装位置

Question

我使用系统安装方法安装了光泽。现在它位于/ usr / local / lib / R / site-library。我正在使用R Studio安装其他软件包，如RMySQL，ShinyBS等。这些软件包位于/home/thisa/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0。现在，当我运行带有以下库的server.R时，

library("shinyBS", lib.loc="/home/thisa/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0")

弹出以下错误。

ERROR: no library trees found in 'lib.loc'

如果我更改R Studio的默认安装目录，那么可能的解决方案是什么呢？那我该怎么做呢？我发现了类似的问题here，但答案对我来说并不清楚。

Answer 1

出于这个原因，我真的不喜欢$HOME以下的本地安装。

这样做：

1. 在R中，执行.libPaths()，它将显示R已知的库目录集。包将进入第一个。

2. 在我的系统上，我只获得"/usr/local/lib/R/site-library"，"/usr/lib/R/site-library" 和"/usr/lib/R/library"

3. 我明确设置（/etc/R/Renviron）R_LIBS_SITE为 ${R_LIBS_SITE-'/usr/local/lib/R/site-library:/usr/lib/R/site-library:/usr/lib/R/library'}排除了用户库。

4. 我可能不得不覆盖RStudio中的默认值，但我现在还没有看到它的位置。您当然可以按照上面的.libPaths()查看。

简而言之，如果你得到我在2中显示的结果，那么你的库将全部以/usr/local/lib/R/site-library结束，并且对所有实例都可见，包括Shiny apps。

Answer 2

对我来说，我遵循了@Dirk上面列出的步骤，我不得不执行一个额外的步骤。 将用户添加到staff组。

在终端运行中。

sudo usermod -a -G staff user_name

用您的用户名替换user_name。重新启动后，再次登录。您应该能够在系统范围内安装软件包。