最近我使用dplyr进行所有数据操作,它是一个很好的工具。但是我无法使用dplyr融合或转换数据框。有没有办法做到这一点?现在我正在使用reshape2来实现这个目的。
我想要'dplyr'解决方案:
require(reshape2)
data(iris)
dat <- melt(iris,id.vars="Species")
答案 0 :(得分:65)
reshape2
的继任者是tidyr
。 melt()
和dcast()
的等效值分别为gather()
和spread()
。那么等同于你的代码就是
library(tidyr)
data(iris)
dat <- gather(iris, variable, value, -Species)
如果您导入了magrittr
,则可以使用dplyr
中的管道运算符,即写入
dat <- iris %>% gather(variable, value, -Species)
请注意,您需要明确指定变量和值名称,这与melt()
不同。我发现gather()
的语法非常方便,因为您可以指定要转换为长格式的列,或者通过在前面加上' - '来指定要保留在新数据框中的列(就像上面的Species一样,它的输入速度比melt()
快一些。但是,我注意到,至少在我的计算机上,tidyr
明显慢于reshape2
。
编辑在回复下面@hadley的评论时,我发布了一些时间信息,比较了我电脑上的两个功能。
library(microbenchmark)
microbenchmark(
melt = melt(iris,id.vars="Species"),
gather = gather(iris, variable, value, -Species)
)
# Unit: microseconds
# expr min lq median uq max neval
# melt 278.829 290.7420 295.797 320.5730 389.626 100
# gather 536.974 552.2515 567.395 683.2515 1488.229 100
set.seed(1)
iris1 <- iris[sample(1:nrow(iris), 1e6, replace = T), ]
system.time(melt(iris1,id.vars="Species"))
# user system elapsed
# 0.012 0.024 0.036
system.time(gather(iris1, variable, value, -Species))
# user system elapsed
# 0.364 0.024 0.387
sessionInfo()
# R version 3.1.1 (2014-07-10)
# Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#
# locale:
# [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C
# [3] LC_TIME=en_GB.UTF-8 LC_COLLATE=en_GB.UTF-8
# [5] LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
# [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C
# [9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
# [11] LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
# attached base packages:
# [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
#
# other attached packages:
# [1] reshape2_1.4 microbenchmark_1.3-0 magrittr_1.0.1
# [4] tidyr_0.1
#
# loaded via a namespace (and not attached):
# [1] assertthat_0.1 dplyr_0.2 parallel_3.1.1 plyr_1.8.1 Rcpp_0.11.2
# [6] stringr_0.6.2 tools_3.1.1
答案 1 :(得分:5)
此外,演员阵容可以使用tidyr::spread()
你的例子
library(reshape2)
library(tidyr)
library(dplyr)
# example data : `mini_iris`
(mini_iris <- iris[c(1, 51, 101), ])
# melt
(melted1 <- mini_iris %>% melt(id.vars = "Species")) # on reshape2
(melted2 <- mini_iris %>% gather(variable, value, -Species)) # on tidyr
# cast
melted1 %>% dcast(Species ~ variable, value.var = "value") # on reshape2
melted2 %>% spread(variable, value) # on tidyr
答案 2 :(得分:2)
使用@Lovetoken的mini_iris
示例添加上述答案(对于评论来说这太复杂了) - 对于那些不了解融化和投射含义的新手。
library(reshape2)
library(tidyr)
library(dplyr)
# example data : `mini_iris`
mini_iris <- iris[c(1, 51, 101), ]
# mini_iris
#Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
#1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
#51 7.0 3.2 4.7 1.4 versicolor
#101 6.3 3.3 6.0 2.5 virginica
Melt正在采用数据框并扩展为一长串值。效率不高,但如果您需要组合数据集,则可能非常有用。 想象一下在桌面上融化并展开的冰块的结构。
melted1 <- testiris %>% melt(id.vars = "Species")
> nrow(melted1)
[1] 12
head(melted1)
# Species variable value
# 1 setosa Sepal.Length 5.1
# 2 versicolor Sepal.Length 7.0
# 3 virginica Sepal.Length 6.3
# 4 setosa Sepal.Width 3.5
# 5 versicolor Sepal.Width 3.2
# 6 virginica Sepal.Width 3.3
您可以看到数据现在如何分成多行值。列名现在是变量列中的文本。
强制转换会重新组合回data.table或data.frame。