我有两个文件,其中file1中的字符串与文件1中字符串的一部分匹配。
问题1: 如何在比赛后输出声部?
文件1:
TGAGGTAGTAGTTTGTACAGTT
TGAGGTAGTAGTTTGTGCTGTT
ACATACTTCTTTATATGCCCATA
file2的:
CGCTCCGTTCTCTTTTGCCTGATTCCAGGCTGAGGTAGTAGTTTGTACAGTTTGAGGGTCTATGATACCACCCGGTACAGGAGATAA
GTCCGCCGGCTCCCACACCATGGCCCTGGCTGAGGTAGTAGTTTGTGCTGTTGGTCGGGTTGTGACATT
TTGTGCACACTGAACCTACCTGCTTGGGACACATACTTCTTTATATGCCCATATGAAC
输出:
TTGCCTGATTCCAGGCTGAGGTAGTAGTTTGTACAG
CACACCATGGCCCTGGCTGAGGTAGTAGTTTGTGCTG
CCTGCTTGGGACACATACTTCTTTATATGCCC
问题2: 如何在比赛前输出部分?
文件1:
GCTGAGGTAGTAGTTTGTACAG
CTGGCTGAGGTAGTAGTTTGTGCT
TTATATGCCC
file2的:
CGCTCCGTTCTCTTTTGCCTGATTCCAGGCTGAGGTAGTAGTTTGTACAG
GTCCGCCGGCTCCCACACCATGGCCCTGGCTGAGGTAGTAGTTTGTGCTG
TTGTGCACACTGAACCTACCTGCTTGGGACACATACTTCTTTATATGCCC
输出:
CGCTCCGTTCTCTTTTGCCTGATTCCAG
GTCCGCCGGCTCCCACACCATGGCCCTGG
TTGTGCACACTGAACCTACCTGCTTGGGACACATACTTCT
如果我只有一个模式,grep -A也可以工作。但是我有多个模式(file1)
答案 0 :(得分:1)
对于比赛前的部分:
awk 'NR==FNR{a[NR]=$0;next} {split($0,b,a[FNR]); print b[1]}' file1 file2
对于之后的部分:
awk 'NR==FNR{a[NR]=$0;next} {split($0,b,a[FNR]); print b[2]}' file1 file2