.csv文件中的多行在R中没有相同数量的元素

Question

我试图将一个非常大的.csv文件读入R

OrigTotalPumping <- read.table("/Users/Larry/Desktop/OrigTotalPumping/MasterOrigFt3.csv", 
                               header=F, sep=",")

我收到错误

  

扫描错误（文件，内容，nmax，sep，dec，quote，skip，nlines，na.strings，：    第19437行没有7个元素

所以我试图简单地跳过该行，但是文件中的多行发生了同样的错误，并且文件太大而无法打开并手动修复。例如

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  line 2 did not have 7 elements

和

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  line 19439 did not have 7 elements

如何设置它以便它可以读取此文件，尽管有这个问题？

Answer 1

不要跳过它，但最好将此代码置于循环和trycatch块下。并对已发布的记录/记录进行错误处理。 如何在R中执行trycatch： 以下是same

的链接

Answer 2

您可以使用这样的awk预处理文件来创建清理文件，其中每行有7个字段吗？

awk 'NF==7' original.csv > cleaned.csv

或者，如果您的字段分隔符是逗号

awk -F',' 'NF==7' original.csv > cleaned.csv

或者，基于@Spacedman的想法，您可以使用awk向您显示没有7个字段的“不快乐”行

awk -F',' 'NF!=7 {print "Line " NR $0}' yourfile.csv | more