PySpark Drop Rows

时间:2014-07-13 01:08:34

标签: python mapreduce apache-spark

如何从PySpark中的RDD中删除行?特别是第一行,因为它往往包含我的数据集中的列名。通过仔细阅读API,我似乎无法找到一种简单的方法来实现这一目标。当然我可以通过Bash / HDFS来做到这一点,但我只是想知道是否可以在PySpark中完成。

6 个答案:

答案 0 :(得分:20)

特定于PySpark:

根据@maasg,您可以这样做:

header = rdd.first()
rdd.filter(lambda line: line != header)

但它在技术上并不正确,因为您可以排除包含数据和标题的行。但是,这似乎对我有用:

def remove_header(itr_index, itr):
    return iter(list(itr)[1:]) if itr_index == 0 else itr
rdd.mapPartitionsWithIndex(remove_header)

类似地:

rdd.zipWithIndex().filter(lambda tup: tup[1] > 0).map(lambda tup: tup[0])

我是Spark的新手,因此无法智能地评论哪一个最快。

答案 1 :(得分:18)

AFAIK没有'简单'的方法来做到这一点。

这应该可以解决问题:

val header = data.first
val rows = data.filter(line => line != header)

答案 2 :(得分:5)

在PySpark(Python API)中实现这一目标的简单方法,假设您使用的是Python 3:

noHeaderRDD = rawRDD.zipWithIndex().filter(lambda row_index: row_index[1] > 0).keys()

答案 3 :(得分:2)

我使用各种解决方案进行了一些分析,并具有以下内容

群集配置

集群

  • 群集1:4核心16 GB
  • 群集2:4核心16 GB
  • 群集3:4核心16 GB
  • 群集4:2核心8 GB

数据

700万行,4列

#Solution 1
# Time Taken : 40 ms
data=sc.TextFile('file1.txt')
firstRow=data.first()
data=data.filter(lambda row:row != firstRow)

#Solution 2
# Time Taken : 3 seconds
data=sc.TextFile('file1.txt')
def dropFirstRow(index,iterator):
     return iter(list(iterator)[1:]) if index==0 else iterator
data=data.mapPartitionsWithIndex(dropFirstRow)

#Solution 3
# Time Taken : 0.3 seconds
data=sc.TextFile('file1.txt')
def dropFirstRow(index,iterator):
     if(index==0):
          for subIndex,item in enumerate(iterator):
               if subIndex > 0:
                    yield item
     else:
          yield iterator

data=data.mapPartitionsWithIndex(dropFirstRow)

我认为解决方案3是最具扩展性的

答案 4 :(得分:1)

我个人认为只使用过滤器来摆脱这些东西是最简单的方法。但根据你的评论,我有另一种方法。 Glom RDD所以每个分区都是一个数组(我假设每个分区有1个文件,每个文件的顶部都有违规行),然后跳过第一个元素(这是scala api)。

data.glom().map(x => for (elem <- x.drop(1){/*do stuff*/}) //x is an array so just skip the 0th index

请记住,RDD的一个重要特性是它们是不可变的,因此自然地删除一行是一件棘手的事情

<强>更新 更好的解决方案 rdd.mapPartions(x => for (elem <- x.drop(1){/*do stuff*/} )
与glom相同但没有将所有内容放入数组的开销,因为在这种情况下x是迭代器

答案 5 :(得分:1)

我已经测试过spark2.1。假设你想要在不知道文件列数的情况下删除前14行。

sc = spark.sparkContext
lines = sc.textFile("s3://location_of_csv")
parts = lines.map(lambda l: l.split(","))
parts.zipWithIndex().filter(lambda tup: tup[1] > 14).map(lambda x:x[0])

withColumn是一个df函数。所以下面的内容不适用于上面使用的RDD样式。

parts.withColumn("index",monotonically_increasing_id()).filter(index > 14)