我正在尝试运行一个应该在多个处理器上运行的编译program。但是使用相同的数据，有时这个程序并行运行，有时它不会（使用相同的PBS脚本文件！）。我怀疑某些计算节点出现了问题，这些计算节点不能让它并行运行（我不能选择我想要的计算节点）。如果这是程序中的错误或计算节点出现问题，我该如何排除故障？
根据系统管理员的说法，我使用的是ulimit -s 100000，但这并没有改变任何内容。此外，该程序不是mpi程序（仅在单个节点上运行，具有多个处理器）。
我运行的代码如下：
quorum_error_correct_reads -q 68 \
--contaminant=/data004/software/GIF/packages/masurca/2.3.0rc1/bin/../share/adapter.jf \
-m 1 -s 1 -g 1 -a 3 --thread=32 -w 10 -e 3 \
quorum_mer_db.jf aa.renamed.fastq ab.renamed.fastq ac.renamed.fastq ad.renamed.fastq ae.renamed.fastq af.renamed.fastq ag.renamed.fastq \
--no-discard -o pe.cor --verbose
感谢您提供任何建议。我将非常感谢您的帮助！ PS：我没有sudo访问权。
编辑：我知道它应该使用多个处理器，因为当我进入节点并执行top -c时，我可以看到（上面的命令）有时像3200 % CPU一样运行（始终）有时只有100 % CPU。这是唯一涉及的步骤，该程序中没有其他子流程。此外，我正在使用HPC，我将作业提交到计算节点，每个计算节点有32个proc，512GB RAM。