Question

我正在使用Genome Diagram来显示基因组信息。我想用断行分隔功能名称及其位置。然后我做了类似的事情：

gdFeature.add_feature(
    feat,
    color=red,
    sigil="ARROW",
    name=feat.qualifiers['product'][0].replace(" ", "_") + "\n" +
    str(feat.location.start) + " - " + str(feat.location.end),
    label_position="middle",
    label_angle=0,
    label=True)

gdFeature是要素类（http://biopython.org/DIST/docs/api/Bio.Graphics.GenomeDiagram._Feature.Feature-class.html）

的一个实例

问题是当我将图片保存为PDF格式时，我得到一个黑色方块而不是一个断行： example here

这不是我想要的。有没有办法做到这一点？

由于

Answer 1

我没有看到直接的路径。 Biopython使用Reportlab生成pdf。在GenomeDiagram中，调用函数drawString来编写名称/标签（函数为here）。即当你传递像“第一行\ n第二行”这样的标签时，ReportLab会生成类似于（数字组成）的PDF代码：

BT /F1 48 Tf 1 0 0 1 210 400 Tm (First\nSecond)Tj ET

但这不是在PDF中打印两行的方法。实际上你必须有两行不同的代码，例如：

BT /F1 48 Tf 1 0 0 1 210 400 Tm (First)Tj ET
BT /F1 48 Tf 1 0 0 1 210 400 Tm (Second)Tj ET

AFAIK，Biopython没有实施。

在基因组图biopython中断线

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