为什么R for循环比使用foreach慢10倍?

时间:2014-07-09 10:49:12

标签: r foreach parallel-foreach

这真让我大吃一惊。基本循环在我的计算机上花了8秒钟:

system.time({
x <- 0
for (p in 1:2) {
    for (i in 1:500) {
        for (j in 1:5000) {
            x <- x + i * j
        }
    }
}
})
x

然而,如果我在非并行模式下使用foreach,它只需要0.7秒!!!

system.time({
x <- 0
foreach(p = 1:2, .combine = rbind) %do% 
    for (i in 1:500) {
        for (j in 1:5000) {
            x <- x + i * j
        }
    }
})
x

结果是一样的,但是foreach能以某种方式比基本R更快地达到它!基本R的低效率在哪里?

这怎么可能?

事实上,与此相比,我获得了完全相反的结果:Why is foreach() %do% sometimes slower than for?

1 个答案:

答案 0 :(得分:9)

顺序使用时,

foreach最终使用compiler使用未导出的函数make.codeBufcmp生成编译的字节代码。您可以使用cmpfun将内环编译为字节码来模拟这个并实现类似的加速。

f.original <- function() {
x <- 0
for (p in 1:2) {
    for (i in 1:500) {
        for (j in 1:5000) {
            x <- x + i * j
        }
    }
}
x
}

f.foreach <- function() {
x <- 0
foreach(p = 1:2, .combine = rbind) %do% 
    for (i in 1:500) {
        for (j in 1:5000) {
            x <- x + i * j
        }
    }
x
}

f.cmpfun <- function(x) {
f <- cmpfun(function(x) {
    for (i in 1:500) {
        for (j in 1:5000) {
            x <- x + i * j
            }
        }
        x
    })
    f(f(0))
}

<强>结果

library(microbenchmark)
microbenchmark(f.original(),f.foreach(),f.cmpfun(), times=5)
Unit: milliseconds
         expr       min        lq    median        uq       max neval
 f.original() 4033.6114 4051.5422 4061.7211 4072.6700 4079.0338     5
  f.foreach()  426.0977  429.6853  434.0246  437.0178  447.9809     5
   f.cmpfun()  418.2016  427.9036  441.7873  444.1142  444.4260     5
all.equal(f.original(),f.foreach(),f.cmpfun())
[1] TRUE